马铃薯NHX基因家族的鉴定与表达模式分析

扫码查看

原文链接

万方数据
维普

中文摘要：NHX基因是一类参与植物对盐胁迫逆境适应的基因家族，在植物对盐胁迫逆境的适应中发挥着重要的作用。为探究马铃薯NHX基因家族的功能和特征及在逆境适应中的潜在作用，从马铃薯基因组中通过生物信息学方法鉴定到7个马铃薯NHX基因，对这些家族成员进行理化性质分析、染色体定位分析、系统进化关系分析、启动子顺式调控元件分析、与miRNA的靶向关系分析、组织表达特异性、生物/非生物胁迫下的表达模式分析。结果表明，7个StNHX基因家族成员分布在1、4、6号染色体上;氨基酸长度为224～1 044个，蛋白分子量在24 698。2～116 236。32 u之间，等电点为在5。95～8。57，亲水系数为0。022～0。623。7个StNHX基因来源于3个邻近复制基因对和3个转座复制基因对，与拟南芥进行物种间共线性分析鉴定到5对直系同源基因对。系统进化分析发现，马铃薯NHX基因可以被分为3个亚群;启动子序列分析发现，StNHX基因含有多个与激素和胁迫响应相关的顺式作用元件。与miRNA靶向关系分析共预测到73个已知的miRNA可能调控7个StNHX基因。全部NHX家族成员在根和萼片中都有表达，StNHX3基因在各个组织中表达量最多，在生物和非生物胁迫下不同成员也呈现出不同的响应模式。本研究结果有助于增加对马铃薯NHX基因家族的了解，为进一步探索马铃薯NHX基因家族的功能和调控机制提供重要的参考。

作者：

黄强、姜伟业、舒婷

展开 >

作者单位：

江西医学高等专科学校基础医学院,江西上饶 334000

关键词：

马铃薯盐胁迫 HX 基因家族

出版年：

2024

DOI：

10.15889/j.issn.1002-1302.2024.15.006

江苏农业科学

江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心

影响因子：0.732

ISSN：1002-1302

年,卷(期)：2024.52(15)