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枳DREB基因家族的鉴定及其对非生物胁迫的响应

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为了解枳(Poncirus trifoliata)DREB基因家族参与非生物胁迫的调控机制，基于枳基因组数据，利用生物信息学方法对枳DREB基因家族成员(PtrDREB)进行全基因组鉴定，讨论PtrDREB各基因的物种进化关系及各基因在不同组织中的表达模式，并用qRT-PCR技术检测9个PtrDREB家族成员在非生物胁迫处理下的相对表达量。结果表明，从枳基因组中共鉴定出48个DREB成员，不均匀地分布在9条染色体上，这些DREB成员编码的蛋白质氨基酸序列长度范围为144～639 aa，相对分子量范围为15 638。35～76 776。34 u，等电点的范围为4。72～9。62，均为亲水性蛋白;34个PtrDREB亚细胞定位于细胞核中;48个PtrDREB基因分为5个亚族;DREB基因的启动子顺式作用元件含有大量光响应、植物激素、非生物胁迫及植物生长发育响应元件;DREB基因家族在不同组织中的表达具有明显差异，在根、果实、叶片、胚珠、种子和幼芽中高表达的基因数目分别为17、13、4、4、6、8个;qRT-PCR数据表明，在经过低温、高温和干旱处理后，9个PtrDREB基因中分别有8、6、1个基因上调表达，上调幅度分别为1。27～5。85、1。44～2。05、2。06倍，因此推测PtrDREB家族成员在非生物胁迫中可能发挥重要的调控作用。

范丽珍、佟晓楠、陈凯、钟静、郑淑芳、张欣悦、董小筠、王心蕊、胡子菲、李兴涛

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赣南师范大学生命科学学院/国家脐橙工程技术研究中心,江西赣州 341000

枳 DREB基因家族 生物信息学 非生物胁迫

2024

10.15889/j.issn.1002-1302.2024.15.007

江苏农业科学
江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心
影响因子：0.732
ISSN：1002-1302
年,卷(期)：2024.52(15)