江苏农业科学2024,Vol.52Issue(16) :69-79.DOI:10.15889/j.issn.1002-1302.2024.16.009

德阳柿SPL基因家族鉴定及在成花调控中的功能分析

李家艳 丁瑜 安怡珂 万建琦 杨勇 关长飞
江苏农业科学2024,Vol.52Issue(16) :69-79.DOI:10.15889/j.issn.1002-1302.2024.16.009

德阳柿SPL基因家族鉴定及在成花调控中的功能分析

李家艳 1丁瑜 1安怡珂 1万建琦 1杨勇 1关长飞1
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作者信息

  • 1. 西北农林科技大学园艺学院,陕西杨凌 712100
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摘要

SPL是植物中重要的转录因子,调控植物从幼年期向成年期转变,为探究DdSPL基因在德阳柿成花调控中的作用,为德阳柿实生苗的早花现象提供依据.本研究采用生物信息学方法对德阳柿SPL基因家族成员进行鉴定,并对其基本理化性质、系统进化关系、保守结构域、基因结构、共线性进行分析;通过融合蛋白瞬时表达鉴定亚细胞定位情况;利用qRT-PCR技术检测其在不同成花时期不同部位[茎、叶、顶芽(花)]的表达情况.结果表明,德阳柿中共鉴定得到38条DdSPL基因序列,通过聚类分析可分为8个亚族,同一聚类的蛋白具有相似的氨基酸结构(2个锌指结构ZN-1、ZN-2和1个核定位信号)和基因结构;保守基序分析发现,所有的DdSPL蛋白均含有SBP结构域.共线性分析结果显示,德阳柿38个SPL基因家族成员中存在49对直系同源基因对.亚细胞定位显示,DdSPL8、DdSPL13、DdSPL18均定位在细胞核中;DdSPL7、DdSPL13、DdSPL18这3个基因的表达模式相似,在幼苗期和现蕾期的茎、叶、顶芽(花)中表达量相对较少,在开花期的叶片中表达量明显提高,可能参与德阳柿成花调控.综上,本研究首次从德阳柿基因组中鉴定出38个SPL家族成员,序列高度保守,且均含有SBP结构域,DdSPL7、DdSPL13、DdSPL18在开花期叶片中高表达,可能参与德阳柿成花调控.

关键词

德阳柿/SPL基因家族/成花调控/基因鉴定/共线性分析

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基金项目

国家重点研发计划(2022YFD2200400)

出版年

2024
江苏农业科学
江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心
影响因子:0.732
ISSN:1002-1302
参考文献量3
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