德阳柿SPL基因家族鉴定及在成花调控中的功能分析

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中文摘要：SPL是植物中重要的转录因子，调控植物从幼年期向成年期转变，为探究DdSPL基因在德阳柿成花调控中的作用，为德阳柿实生苗的早花现象提供依据。本研究采用生物信息学方法对德阳柿SPL基因家族成员进行鉴定，并对其基本理化性质、系统进化关系、保守结构域、基因结构、共线性进行分析;通过融合蛋白瞬时表达鉴定亚细胞定位情况;利用qRT-PCR技术检测其在不同成花时期不同部位[茎、叶、顶芽(花)]的表达情况。结果表明，德阳柿中共鉴定得到38条DdSPL基因序列，通过聚类分析可分为8个亚族，同一聚类的蛋白具有相似的氨基酸结构(2个锌指结构ZN-1、ZN-2和1个核定位信号)和基因结构;保守基序分析发现，所有的DdSPL蛋白均含有SBP结构域。共线性分析结果显示，德阳柿38个SPL基因家族成员中存在49对直系同源基因对。亚细胞定位显示，DdSPL8、DdSPL13、DdSPL18均定位在细胞核中;DdSPL7、DdSPL13、DdSPL18这3个基因的表达模式相似，在幼苗期和现蕾期的茎、叶、顶芽(花)中表达量相对较少，在开花期的叶片中表达量明显提高，可能参与德阳柿成花调控。综上，本研究首次从德阳柿基因组中鉴定出38个SPL家族成员，序列高度保守，且均含有SBP结构域，DdSPL7、DdSPL13、DdSPL18在开花期叶片中高表达，可能参与德阳柿成花调控。

作者：

李家艳、丁瑜、安怡珂、万建琦、杨勇、关长飞

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作者单位：

西北农林科技大学园艺学院,陕西杨凌 712100

关键词：

德阳柿 SPL基因家族成花调控基因鉴定共线性分析

基金：

国家重点研发计划

项目编号：

2022YFD2200400

出版年：

2024

DOI：

10.15889/j.issn.1002-1302.2024.16.009

江苏农业科学

江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心

影响因子：0.732

ISSN：1002-1302

年,卷(期)：2024.52(16)

参考文献量3