摘要
为了探索枇杷对于干旱胁迫响应和耐受性的分子机制,鉴定可用于培育抗旱枇杷新品种的关键基因,为枇杷抗旱机制提供理论依据,以白玉枇杷为试验材料,通过转录组测序(RNA-Seq)筛选响应干旱胁迫的差异表达基因.以正常供水为对照,进行短期干旱胁迫处理,RNA-Seq筛选差异表达基因(DEG),并对差异表达基因进行GO和KEGG功能富集分析.结果表明,RNA-Seq共鉴定出3 270个DEG,其中上调1 810个,下调1 460个.GO富集分析表明,一些胁迫响应基因在干旱处理后显著上调.KEGG富集分析表明,植物MAPK信号通路、植物激素信号转导、类胡萝卜素生物合成等相关DEG在响应胁迫中发挥关键作用.对DEG深入分析发现,干旱胁迫后,抗氧化酶基因、脱落酸(ABA)生物合成基因NCED、ABA信号通路基因显著上调.此外,通过分析转录因子,发现枇杷主要通过调控bHLH、bZIP、AP2/ERF、GRAS、HD-Zip、MYB、MYB_related、NAC、WRKY 这 9 个家族转录因子的表达来响应干旱.
基金项目
江苏省高等学校基础科学(自然科学)研究面上项目(22KJD210003)
江苏省珍稀树种白沙枇杷种质资源保护与培育长期科研基地项目(LYKJ[2020]28)
江苏省现代农业(特色果树)产业技术体系建设专项(JATS[2021]395)
苏州农业职业技术学院博士提升计划科研启动基金(BS[2022]01)
维普
万方数据