基于转录组分析枇杷响应干旱胁迫的分子机制

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中文摘要：为了探索枇杷对于干旱胁迫响应和耐受性的分子机制,鉴定可用于培育抗旱枇杷新品种的关键基因,为枇杷抗旱机制提供理论依据,以白玉枇杷为试验材料,通过转录组测序(RNA-Seq)筛选响应干旱胁迫的差异表达基因.以正常供水为对照,进行短期干旱胁迫处理,RNA-Seq筛选差异表达基因(DEG),并对差异表达基因进行GO和KEGG功能富集分析.结果表明,RNA-Seq共鉴定出3 270个DEG,其中上调1 810个,下调1 460个.GO富集分析表明,一些胁迫响应基因在干旱处理后显著上调.KEGG富集分析表明,植物MAPK信号通路、植物激素信号转导、类胡萝卜素生物合成等相关DEG在响应胁迫中发挥关键作用.对DEG深入分析发现,干旱胁迫后,抗氧化酶基因、脱落酸(ABA)生物合成基因NCED、ABA信号通路基因显著上调.此外,通过分析转录因子,发现枇杷主要通过调控bHLH、bZIP、AP2/ERF、GRAS、HD-Zip、MYB、MYB_related、NAC、WRKY 这 9 个家族转录因子的表达来响应干旱.

作者：

赵双、尤伟忠、汪溢、郄红丽

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作者单位：

苏州农业职业技术学院,江苏苏州 215008

江苏省太湖常绿果树技术推广中心,江苏苏州 215107

江苏省农业种质资源保护与利用平台,江苏南京 210014

关键词：

枇杷干旱胁迫转录组分析差异基因表达

基金：

江苏省高等学校基础科学(自然科学)研究面上项目江苏省珍稀树种白沙枇杷种质资源保护与培育长期科研基地项目江苏省现代农业(特色果树)产业技术体系建设专项苏州农业职业技术学院博士提升计划科研启动基金

项目编号：

22KJD210003LYKJ[2020]28JATS[2021]395BS[2022]01

出版年：

2024

DOI：

10.15889/j.issn.1002-1302.2024.17.004

江苏农业科学

江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心

影响因子：0.732

ISSN：1002-1302

年,卷(期)：2024.52(17)