江苏农业科学2024,Vol.52Issue(17) :34-46.DOI:10.15889/j.issn.1002-1302.2024.17.005

番茄CYP450基因家族鉴定及病原菌胁迫相关成员的生物信息学分析

那日松 杨莹 王孟豪 关皓文 马心如 曹亚男
江苏农业科学2024,Vol.52Issue(17) :34-46.DOI:10.15889/j.issn.1002-1302.2024.17.005

番茄CYP450基因家族鉴定及病原菌胁迫相关成员的生物信息学分析

那日松 1杨莹 1王孟豪 1关皓文 1马心如 1曹亚男1
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作者信息

  • 1. 河南农业大学植物保护学院,河南郑州 450046
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摘要

细胞色素P450(cytochrome P450,CYP450)酶是陆地植物中最大的酶蛋白基因家族,具广泛催化活性,参与植物多种初生代谢和次生代谢产物的生物合成.分析番茄(Solarium lycopersicum L.)CYP450基因家族成员的数量、序列特点、系统演化关系、在病原菌诱导下的表达模式和互作网络,为阐明番茄CYP450基因的生物学功能奠定基础.通过HMM检索和BLAST比对2种方法在番茄中得到328条CYP450序列,归属于9个家族簇;理化性质分析结果显示番茄CYP450蛋白大多为亲水性蛋白质,包含丰富的碱性氨基酸,主要定位于叶绿体和质膜;番茄叶霉病病菌(Cladosporium fulvum)诱导条件下的59个差异表达基因分属7个家族簇,相同家族簇成员具相似蛋白保守基序和基因结构;16个与聚炔类合成关键基因有相似表达模式的基因均来自CYP71和CYP72家族簇,它们可能在聚炔类合成通路的下游发挥重要作用,但其功能还需进一步验证.

关键词

番茄/聚炔类化合物/CYP450基因家族/番茄叶霉菌/生物信息学分析

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基金项目

国家自然科学基金(31800179)

河南省杰出青年科学基金(232300421008)

出版年

2024
江苏农业科学
江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心
影响因子:0.732
ISSN:1002-1302
参考文献量36
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