甘薯WRKY基因家族鉴定及其响应茎腐病侵染的表达分析

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中文摘要：WRKY基因家族是植物中重要的转录因子家族，在植物响应生物和非生物胁迫过程中起到非常重要的调控作用。通过生物信息学方法在甘薯基因组(pasi3)鉴定了 84个WRKY家族基因，分布于15条染色体，编码氨基酸数量为120～838个，等电点为4。89～10。74。系统发育树将其分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ簇，其中Ⅱ簇又分为5个亚群(Ⅱ-a、Ⅱ-b、Ⅱ-c、Ⅱ-d、Ⅱ-e)。保守结构域显示，IbWRKY基因具有高度保守的WRKYGQK基序，其中有11个基因的保守基序发生了变异。IbWRKY基因的启动子中存在多个与生长发育、激素响应和应激反应相关的顺式作用元件。共线性分析结果表明，甘薯与拟南芥、番茄和马铃薯等双子叶植物的WRKY基因具有相似的进化历程。IbWRKY基因在甘薯中具有显著的组织特异性，且在生物、非生物胁迫和激素处理下表达差异显著。73个IbWRKY基因参与了茎腐病胁迫响应，其中IbWRKY20/40/6/84等4个基因与茎腐病抗性密切相关。本研究鉴定了 84个甘薯WRKY基因，并明确了其家族特征、进化和表达模式。同时，挖掘到了 4个与茎腐病抗性密切相关的WRKY基因。

作者：

丁夏威、田沺、陈健文、陈景益、王章英、邹宏达、黄立飞

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作者单位：

华南农业大学农学院,广东广州 510640

广东省农业科学院作物研究所/广东省农作物遗传改良重点实验室,广东广州 510640

仲恺农业工程学院农学院,广东广州 510640

关键词：

甘薯 WRKY 茎腐病生物信息学表达模式

出版年：

2024

DOI：

10.15889/j.issn.1002-1302.2024.21.004

江苏农业科学

江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心

影响因子：0.732

ISSN：1002-1302

年,卷(期)：2024.52(21)