摘要
WRKY基因家族是植物中重要的转录因子家族,在植物响应生物和非生物胁迫过程中起到非常重要的调控作用.通过生物信息学方法在甘薯基因组(pasi3)鉴定了 84个WRKY家族基因,分布于15条染色体,编码氨基酸数量为120～838个,等电点为4.89～10.74.系统发育树将其分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ簇,其中Ⅱ簇又分为5个亚群(Ⅱ-a、Ⅱ-b、Ⅱ-c、Ⅱ-d、Ⅱ-e).保守结构域显示,IbWRKY基因具有高度保守的WRKYGQK基序,其中有11个基因的保守基序发生了变异.IbWRKY基因的启动子中存在多个与生长发育、激素响应和应激反应相关的顺式作用元件.共线性分析结果表明,甘薯与拟南芥、番茄和马铃薯等双子叶植物的WRKY基因具有相似的进化历程.IbWRKY基因在甘薯中具有显著的组织特异性,且在生物、非生物胁迫和激素处理下表达差异显著.73个IbWRKY基因参与了茎腐病胁迫响应,其中IbWRKY20/40/6/84等4个基因与茎腐病抗性密切相关.本研究鉴定了 84个甘薯WRKY基因,并明确了其家族特征、进化和表达模式.同时,挖掘到了 4个与茎腐病抗性密切相关的WRKY基因.
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