月季水通道蛋白基因家族的生物信息学特征及干旱下的表达分析

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万方数据
维普

中文摘要：水通道蛋白(AQP)是高度多样化的内在蛋白家族，可运输水和中性溶质，在植物发育和胁迫反应中起着至关重要的作用。然而关于月季(Rosa chinensis)AQP的组成和生物学功能仍知之甚少，以月季品种坦尼克为试验材料，基于全基因组分析，对月季AQP家族成员进行鉴定和生物信息学分析，并分析相关基因在干旱胁迫下的表达情况。结果表明，共鉴定出61个AQP编码基因的非冗余成员，其中57个可定位于9条染色体上。系统发育分析结果表明，月季AQP(RsAQP)分为4个亚家族，包括21个质膜内在蛋白(PIP)、19个液泡膜内在蛋白(TIP)、16个NOD样内在蛋白(NIP)和5个小碱性内在蛋白(SIP)，所有RsAQP都包含共同的高度保守基序、跨膜区域及多种顺式作用元件，表明RsAQP具有潜在跨膜转运功能。RNA-Seq表达模式分析结果表明，PIP1表达水平普遍高于其他亚群;qRT-PCR结果进一步表明，7 个 PIP1 亚群成员中，6 个基因(RsPIP1-1、RsPIP1-2、RsPIP1-3、RsPIP1-4、RsPIP1-6、RsPIP1-7)在干旱胁迫下上调表达，以RsPIP1-6表达水平最高、契合度最高，推测RsPIP1-6可能是月季耐旱的关键基因。

作者：

李雪芬、邓小辉、陈清华

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作者单位：

广安职业技术学院,四川广安 638000

四川省农业科学院植物保护研究所,四川成都 610066

关键词：

月季水通道蛋白质膜内在蛋白(PIP) 全基因组干旱胁迫

出版年：

2024

DOI：

10.15889/j.issn.1002-1302.2024.22.003