摘要
为探讨沙门氏菌感染对番鸭的影响,拟通过转录组测序技术分析沙门氏菌感染番鸭后不同时间法氏囊组织的转录调控.利用肠炎沙门氏菌感染14 d雏番鸭,感染后1、3、10 d采集试验组和对照组法氏囊组织样本,提取RNA,利用Illumina测序平台进行测序,通过生物信息学分析鉴定不同时间点转录组变化、信号通路和功能.结果表明,在番鸭感染沙门氏菌1、3、10 d分别发现9、97、4个差异基因(P＜0.05,|log2 fold change|＞1).GO分析结果表明,3个时间点中这些差异基因在生物学进程、分子功能、细胞部分均有富集.KEGG分析结果表明,感染1 d时,差异基因主要富集于集合管的酸分泌、霍乱弧菌感染、癌症通路中;感染3 d时,差异基因主要富集于代谢信号通路、脂肪细胞脂解的调控及IgA产生的肠道免疫网络;感染10 d,差异基因主要富集在亨廷顿舞蹈症、肌萎缩侧索硬化症、多种疾病的神经退行性途径.其中,沙门氏菌感染1 d的差异基因ATP6V0A4,沙门氏菌感染3 d的差异基因IL-15、PTGS2、IGHV3-23主要参与了这些信号通路,提示这些基因可能在番鸭沙门氏菌感染过程中发挥重要作用.
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