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鱼油和豆油作为饲料脂肪源对彭泽鲫亲本卵巢组织转录组分析

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为探究鱼油和豆油作为饲料脂肪源对彭泽鲫亲本卵巢发育的影响,将健康的初始体质量为253.78±5.34 g的彭泽鲫分别以鱼油(FO)和豆油(SO)两种脂肪源的试验饲料饲喂60 d.采用Illumina NovaSeq 6000高通量测序平台对彭泽鲫亲本卵巢组织进行转录组测序.然后将所测序列经质控,组装后对比到GO KEGG等数据库中进行注释,并对其进行差异基因等的聚类分析.试验结果显示,FO组平均得到4.33 × 107条Raw Reads,原始数据过滤掉测序接头序列、未知碱基序列、低质量序列后平均得到4.19 × 107条Clean Reads,碱基数6.50Gb;SO组平均得到4.30 × 107条Raw Reads,原始数据过滤掉测序接头序列、未知碱基序列、低质量序列后平均得到4.15 ×107条Clean Reads,碱基数6.45Gb.经过纯化后,Q20比例在97.25％以上,Q30比例在91.55％以上.在SO组相对FO组比较中,按照q＜0.05和|log2FC(SO/FO)|＞1的筛选条件,得到425个差异表达基因(DEGs),显著上调基因有290个,显著下调基因有135个,共筛选出7个性腺发育相关基因,其中6个基因显著上调,1个基因显著下调.对DEGs进行GO功能分析表明,差异表达的基因对比到GO数据库共898个GO term,这些term分别对应细胞组分,分子功能以及生物过程等三大类,差异基因主要涉及到生物调控、细胞过程、代谢过程和刺激反应等.通过KEGG富集分析结果表明,两组样本之间的差异表达基因富集194条通路,主要涉及细胞进程、环境信息处理、遗传信息处理、新陈代谢、有机系统等五大类代谢通路.其中细胞生长和死亡、信号分子和相互作用、氨基酸代谢和脂类代谢等富集显著.

肖俊、姚远、龚海波、巫伟华、龙凡、丁立云

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江西省水产科学研究所,江西南昌 330039

农业农村部湖泊渔业资源环境科学观测实验站,江西南昌 330039

江西省水生生物保护救助中心,江西南昌 330096

彭泽鲫亲本 脂肪源 转录组测序 差异表达基因 KEGG富集

江西省重点研发计划江西省现代农业产业技术体系江西省农牧渔业科研指导性课题

20203BBF63045JXARS-032023-35

2024

江西水产科技
江西省水产科学研究所,江西省水产学会

江西水产科技

影响因子：0.142
ISSN：1006-3188
年,卷(期)：2024.(4)
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