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基于整合分析基因表达数据筛选急性胰腺炎中差异表达基因

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目的 了解急性胰腺炎(acute pancreatitis,AP)的生物学和分子发病机制,为预防和治疗AP提供依据.方法 从基因表达总库数据库获取基因表达数据集GSE109227、GSE3644和GSE65146,其中包括AP小鼠和对照小鼠胰腺样本的基因表达谱.使用GEO2R鉴定所有差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并使用基因本体(gene ontology,GO)和京都基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Gen-omes,KEGG)富集分析进行注释.结果 在GSE109227、GSE3644和GSE65146数据集中发现38个共同的DEGs,将其构建成1个蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,确定了枢纽蛋白,并提取了功能模块.通过PPI网络分析确定参与粘连接头通路的3个基因(Cdh1、Iqgap1和Actn4),可能为AP的诊断和治疗提供潜在的生物标志物.结论 Cdh1、Iqgap1和Actn4基因对AP的发生和发展有影响,这可能为AP的诊断和治疗提供新的靶点.

曾春艳、李俊、陈幼祥

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南昌大学第一附属医院消化内科

江西省中西医结合医院消化内科,南昌 330006

急性胰腺炎 差异表达基因 GO和KEGG分析 蛋白质-蛋白质相互作用 生物标志物

江西省卫健委科技计划项目江西省卫健委科技计划项目

202031042019A046

2024

10.13764/j.cnki.ncdm.2024.05.012

南昌大学学报(医学版)
南昌大学

南昌大学学报(医学版)

CSTPCD
影响因子：1.008
ISSN：2095-4727
年,卷(期)：2024.64(5)