财政部2017年印发的《政府会计制度——行政事业单位会计科目和报表》(财会〔2017〕25号)自2019年1月1日起施行.原执行分行业会计制度的科研事业单位,在双功能、双基础、双报告,对现金收支平行记账的政府会计制度下,如何解决实际工作中遇到的问题、如何进行账务处理都需要提供解决方案.在文件中,仅列举了框架式的基本账务处理模式,并不能解决工作中的全部实际业务账务处理问题.本文以所在科研事业单位为例,探讨科研事业单位在政府会计制度改革背景下面临的机遇与挑战,从科研事业单位对课题经费的管理要求出发,阐述两种制度转换下,课题到款及收入确认、课题支出核算的变化,并结合工作实际中遇到的问题,提出双分录下课题经费核算的解决方案,引入虚拟课题概念,并在课题到款或确认收入涉及应交税金—应交增值税科目时,采用两步式核算,既能在预算会计中查询到课题实际到款金额,又符合政府会计的核算原则,为课题经费核算提供解决方案,为实物工作提供建议和借鉴.