行政事业单位在我国管理体系中隶属于政府,作为我国行政职能的行使主体为社会公众提供相关的基础服务.与企业组织不同,其资金大多由国家直接划拨,没有市场竞争的压力,经营管理缺乏动力,内控制度建设没有得到重视.随着社会经济的发展,内控制度缺失的弊端日益显露,严重影响国有资产的有效利用和工作效率的提高.近年来,随着行政事业单位体制的改革,同时为了进步提高行政事业单位内部管理水平,加强风险防控能力,我国行政事业单位开始实施一系列内控措施,内控水平也得到了很大的提升.随着市场经济的高速发展,行政事业单位内控建设的标准和要求也越来越细、越来越高.但是,在新时代的背景下,我国行政事业单位的内部控制还存在着意识欠缺、制度不完善、机构不独立等问题.本文通过分析行政事业单位内部控制建设的必要性,进一步分析行政事业单位内部控制存在的问题,基于此,对产生问题的主要原因进行分析,进而提出相应的解决措施,以期对我国行政事业单位内部控制建设的有效性和科学性有所助益,从而促进行政事业单位有效健康的运行.