近年来,随着国家综合实力的提高,国家对科研项目经费的投入力度持续加大,以企业为主体的科研攻关团队正逐渐成为我国科研事业发展的重要力量.当前,企业从国家科技重大专项项目、国家科技支撑计划项目和地方政府各层级的项目中,获得了各种科研专项经费,科研经费结构日益多样化.并且,科研经费管理因不同的科研项目经费管理制度不同而复杂化,科研项目经费审计也愈加严格,因此科学、合理的企业科研项目经费内部控制管理不仅能促进科研项目的顺利进展,更能提高企业自身的综合竞争力.但是,目前在科研项目经费内部控制管理方面,大部分企业在制定和执行中仍存在许多问题,如何对这些科研项目经费进行管理,制定管理制度,规范使用科研项目经费,严格根据科研项目预算进度执行,从而达到提高科研项目的管理水平,提高科研项目经费的使用效果,就显得非常重要.本文在分析企业科研项目经费内部控制管理的重要性基础上,探讨了目前企业科研项目经费内部控制管理存在的问题,分析了问题的成因,并提出了完善企业科研项目经费内部控制管理的对策措施.