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毛果杨LBD基因家族的全基因组分析

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LBD (lateral organ boundaries domain)蛋白是一类植物所特有的转录因子,在调控植物生长发育、营养代谢以及逆境胁迫的响应等方面发挥重要作用.然而,在基因组水平上对毛果杨LBD基因家族的研究还未曾有过报道.本研究利用生物信息学方法,从毛果杨基因组中鉴定出57个LBD基因并预测其分子量和等电点,这些基因分布于毛果杨18条染色体和Scaffold_ 65、Scaffold_ 86上.该家族成员基因结构简单,内含子数目不超过2个.进化关系分析显示毛果杨LBD基因可分为Class Ⅰ和ClassⅡ两大类,细分为Ⅰa、Ⅰb、Ⅰc、Ⅰd、Ⅰe、Ⅱa和Ⅱb等7个亚类.分析基因表达模式发现,该家族成员的表达具有一定时空特异性,并响应氮素胁迫处理.本研究为深入研究毛果杨LBD基因的功能奠定了基础.
Genome-Wide Analysis of Gene Family of Lateral Organ Boundaries Domain in Populus trichocarpa

芦强、邵芬娟、邱德有

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中国林业科学研究院林业研究所,北京,100091

毛果杨 LBD基因家族 系统进化分析 基因表达

国家重点研发计划“极小种群野生植物就地保护及生境恢复技术研究与示范”课题

2016YFC0503103

2018

10.13417/j.gab.037.000313

基因组学与应用生物学
广西大学

基因组学与应用生物学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.108
ISSN：1674-568X
年,卷(期)：2018.37(1)
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