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坡柳(Dodonaea viscosa L.)丛枝植原体新病原的分子鉴定

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从四川攀枝花芒果园中表现为丛枝、小叶和黄花等症状的坡柳植株发病样品中,利用植原体16SrDNA基因的通用引物R16mF2/R16mR1和R16F2n/R16R2,对发病植株总DNA进行巢式PCR检测,同时设计植原体抗原膜蛋白基因(AntMP)的保守引物AntMP-F/AntMP-R进行PCR验证.结果显示,坡柳样品巢式PCR的第一轮、第二轮DNA条带大小分别为1400 bp和1200 bp左右,经NCBI序列相似性比较均为植原体16S rDNA序列,GenBank登录号为KT957205和KT957206;PCR结果显示抗原膜蛋白基因大小约600 bp,与目标基因大小一致.将测得的16S rDNA基因序列与GenBank数据库中登录的16Sr Ⅰ~Ⅹ Ⅴ组植原体16S rDNA序列进行同源性比对,构建系统进化树,结果显示四川坡柳丛枝植原体(DOVI-SC)属于16Sr Ⅰ组(即翠菊黄花组),与己报道的5个16Sr Ⅰ组(AY101386,AY566302,AY389822,L33760和KP662119)同属一个组.利用植原体亚组分类鉴定软件iPhyClassfier对获得的2条植原体16S rDNA序列进行虚拟RFLP分析,结果显示KT957205,KT957206与16Sr Ⅰ-B亚组洋葱黄化植原体(NC-005303)相似度分为1.0、0.97,归属于16Sr Ⅰ-B亚组.本研究对引起四川坡柳丛枝的植原体病原进行检测,为坡柳植原体病害的早期诊断、快速检测以及预防措施制定提供科学线索.
Molecular Identification of a New Pathogen of Dodonaea viscosa L.Witches' Broom Phytoplasma

笈小龙、吴育鹏、谢慧敏、余乃通、王健华、张秀春、刘志昕

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海南大学热带农林学院,海口,570228

中国热带农业科学院热带生物技术研究所,农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室,海口,571101

文昌市农产品质量安全检验检测站,文昌,571300

坡柳 植原体 分子鉴定 系统进化树

海南省重大科技计划项目海南省热带果树生物学重点实验室开放课题中国热带作物学会青年人才托举工程项目

ZDKJ2017003KFZX2017002CSTC-QN2017004

2018

基因组学与应用生物学
广西大学

基因组学与应用生物学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.108
ISSN:1674-568X
年,卷(期):2018.37(6)
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