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木薯SWEETs基因家族生物信息学及表达特性研究

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SWEET (sugars will eventually be exported transporters)是植物中新发现的一类编码糖转运蛋白的基因,它在植物生长发育及糖代谢过程中发挥重要作用.该基因家族在木薯(Manihot esculenta)中尚未有详细的报道.本研究从Phytozome数据库获得了28个木薯SWEET候选基因并对其进行生物信息学分析,在华南124的木薯苗中通过荧光定量实验检测SWEET基因在旱胁迫下的表达水平.结果发现木薯SWEET基因被分为4簇,主要分布在第6条和第14条染色体上,编码234 aa与302 aa之间的氨基酸序列;木薯SWEET基因家族的表达在旱胁迫条件下发生了变化,其中明显上调的基因有9个,包括MeSWEETlb、MeS WEET2a、MeSWEET6、MeSWEET9a、MeSWEET9b、MeSWEET12、MeSWEET15a、MeSWEET15b和MeSWEET16c;而表达量明显下调的基因也有9个,为MeSWEET2b、MeSWEET3b、MeSWEET4、MeSWEET7、MeSWEETll、MeSWEET16a、MeSWEET16b、MeSWEET17a和MeSWEET17c.这些结果为进一步阐明SWEET基因家族在木薯中的功能提供理论依据.
Bioinformatics Analysis and Expressional Characteristics of Cassava SWEETs Gene Family

薛蓓蓓、覃丽芳、董明右、李有志、樊宪伟

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广西大学,生命科学与技术学院,亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁,530004

木薯 SWEET基因 旱胁迫 基因表达

本研究由广西自然科学基金广西高等教育本科教学改革工程项目

No.2015GXNSFAA139078和2016JGA135

2019

基因组学与应用生物学
广西大学

基因组学与应用生物学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.108
ISSN:1674-568X
年,卷(期):2019.38(1)
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