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甘薯基因组JAZ基因家族的鉴定与分析

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JAZ(jasmonate ZIM-domain,JAZ)蛋白作为茉莉酸途径的抑制因子,可通过与其他信号通路的调控因子互作来调节植物生长发育过程.为了探究甘薯[Ipomoea batatas(L.)LAM]JAZ家族基因的特征和潜在功能,本研究利用生物信息学的分析方法从甘薯全基因序列中鉴定到11个JAZ基因序列,对其进行多重序列比对、染色体定位、保守基序、系统进化树以及逆境胁迫下基因表达量变化等多方面的研究.结果表明,11个甘薯JAZ基因分布在甘薯1号、3号、6号、7号和9号染色体上,其数目分别为2个、1个、2个、1个和5个;利用MEME检索工具从甘薯JAZ家族蛋白序列中检索得到9个保守基序(motif 1～motif 9),其中motif 1和motif 7氨基酸序列组成与多重比对结果中的TIFY结构域一致,motif 2序列特征与Jas结构域一致;甘薯、拟南芥和水稻的JAZ家族系统进化树可分为5个亚组(Groupl～Group 5);转录组数据分析结果表明,甘薯JAZ基因家族中有2个成员在受到尖孢镰刀菌(Fusariumoxysporum f.sp.batatas)侵染时表达量上调;有5个成员在低温胁迫下差异表达,其中3个表达上调、2个表达下调.以上结果可为研究甘薯JAZ家族基因的结构和功能提供参考.
Identification and Analysis of JAZ Gene Family in Ipomoea batatas Genome

黄小芳、毕楚韵、陈其俊、刘江洪、胡韵卓、黄碧芳、许明、陈选阳、林世强

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福建农林大学作物生物技术福建省高校重点实验室,福州,350002

福建农林大学农学院,福州,350002

福建省种子总站,福州,350003

福建农林大学生命科学学院,福州,350002

福建省特种作物育种与利用工程技术研究中心,福州,350002

福建农林大学教育部作物遗传育种与综合利用重点实验室,福州,350002

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甘薯 JAZ 基因家族 生物信息学

福建省科技厅项目福建省科技厅项目

2020N50132019N0050

2021

10.13417/j.gab.040.003685

基因组学与应用生物学
广西大学

基因组学与应用生物学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.108
ISSN：1674-568X
年,卷(期)：2021.40(11)
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