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紫色马铃薯bHLH转录因子家族基因的鉴定及表达分析

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bHLH转录因子家族是第二大转录因子家族,在植物生长发育、花青素生物合成途径的调控、逆境胁迫响应等发挥重要作用.为挖掘马铃薯(Solanum tuberosum)的紫色块茎花青素合成相关的bHLH基因,本研究基于紫色马铃薯转录组测序数据筛选bHLH基因,通过生物信息学方法对其进行序列分析,对bHLH基因在不同时期的表达与功能进行分析与预测,并通过RT?qPCR技术分析花青素合成相关的5个bHLH基因在不同发育时期的表达水平.结果表明:紫色马铃薯中筛选出103个bHLH基因,编码的蛋白大小在129～699 aa,等电点在4.65～9.75,均为亲水性蛋白;碱性区域由15个碱性氨基酸组成,均有高度保守的H5?E9?R12序列(His5?Glu9?Arg12),两个螺旋区内含有高度保守的亮氨酸(L)、精氨酸(R)和缬氨酸(V);基序预测得到2个保守基序,最长的基序含35个氨基酸;有36个bHLH基因在整个生育期呈下调表达、有67个bHLH基因呈上调表达,其中41个bHLH基因在3个发育时期差异表达显著;103个紫色马铃薯bHLH基因与拟南芥(Arabidopsis thaliana)bHLH基因聚类为13个亚族;GO富集分析发现103个bHLH基因广泛参与花青素生物合成、防御反应、生长发育等72项功能,其中参与花青素和类黄酮合成的bHLH基因有5个,其RT?qPCR结果与测序表达一致.
Identification and Expression Analysis of bHLH Transcription Factor Family Genes in Purple Potato

王沛捷、马艳红、武小娟、范菠菠、赵娜勤

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内蒙古农业大学农学院,呼和浩特, 010019

紫色马铃薯 bHLH转录因子 基因序列 差异表达分析 RT?qPCR

内蒙古自治区科技重大专项内蒙古自治区科技计划内蒙古自治区马铃薯种业技术创新中心项目(2020)

zdzx20180192020GG0221

2022

10.13417/j.gab.041.000601

基因组学与应用生物学
广西大学

基因组学与应用生物学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.108
ISSN：1674-568X
年,卷(期)：2022.41(3)
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