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纳米孔基因测序技术在DNA甲基化修饰检测中的应用研究进展

Advances in Application of Nanopore Sequencing Technology in DNA Methylation Detection

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DNA甲基化是最常见的表观遗传修饰类型之一,其中哺乳动物基因组中最常见的5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)甲基化修饰参与了许多重要的生命活动,其含量的异常与疾病,尤其是癌症的发生发展密切相关.当前检测5mC修饰最常用的方法是基于亚硫酸氢盐转化的第二代基因测序技术,该方法虽然转化效率高且测定准确,但仍然存在不足之处,包括DNA分子降解、处理过程繁杂、测序读长较短、检测特异性不高等.近些年发展起来的纳米孔基因测序技术凭借其能对DNA修饰直接进行检测,且具有读长长、通量高、速度快等特点,在DNA表观遗传修饰检测方面展现了良好优势.本文对DNA的5mC修饰的形成及其经典的检测方法进行了简要介绍,并重点介绍了纳米孔基因测序技术在DNA的5mC修饰检测中的应用研究进展.

谢水莲、袁丰华、李梦婷、万绍贵

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赣南医学院基础医学院分子病理中心,赣州,341000

纳米孔基因测序技术 DNA甲基化 5-甲基胞嘧啶

国家自然科学基金江西省科技创新杰出青年人才培养计划

8206052420192BCBL23017

2022

10.13417/j.gab.041.000927

基因组学与应用生物学
广西大学

基因组学与应用生物学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.108
ISSN：1674-568X
年,卷(期)：2022.41(4)
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