近年来,我国随着城市人口不断的增长,导致城市拥挤问题越来越严重。为了解决这一个问题,全国很多城市都已经或者开始发展高效率的地下有轨公共交通——地铁,形成四通八达的地下交通网。因为在地铁开挖和运营过程中出现了很多各种各样的问题,比如在开挖过程中存在地表塌陷,在运营过程中地面下沉等。地铁隧道地表塌陷最直接原因是地表的变形,而地表变形是可以监测的。本文将利用基因表达式编程方法进行地铁变形预测分析。通过实验结果表明基因表达式编程在地铁隧道地表变形预测精度明显提高,而且速度也有所提高,从而为预测地铁隧道地表变形提供了一种新方法。