中华急诊医学杂志2024,Vol.33Issue(1) :95-100.DOI:10.3760/cma.j.issn.1671-0282.2024.01.016

脓毒症患者外周血中lncRNA和miRNA表达谱及功能分析

李兴 宋春梅 卢文辉 穆根华 卢仲谦 邓义军
中华急诊医学杂志2024,Vol.33Issue(1) :95-100.DOI:10.3760/cma.j.issn.1671-0282.2024.01.016

脓毒症患者外周血中lncRNA和miRNA表达谱及功能分析

李兴 1宋春梅 2卢文辉 2穆根华 1卢仲谦 1邓义军1
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作者信息

  • 1. 徐州医科大学附属盐城临床学院重症医学科,盐城 224055
  • 2. 盐城市第三人民医院重症医学科,盐城 224008
  • 折叠

摘要

目的 本研究利用二代测序(next-generation sequencing,NGS)技术,对脓毒症患者外周血液进行测序分析,探讨非编码小RNA(microRNA,miRNA)和长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)的差异表达及其功能网络.方法 本研究采集2021年6月至9月在盐城市第一人民医院招募的重症医学科7例泌尿系统感染的脓毒症患者和3例健康职工志愿者的全血进行NGS分析,筛选差异表达的mRNA、lncRNA和miRNA,并对差异表达进行生物信息学分析(差异倍数FC>2,P<0.01).本研究筛选并下载GEO数据库中4个脓毒症患者基因组数据集,筛选共同差异表达基因,对筛选基因进行京都基因组百科全书分析.使用Cytoscape3.7.0进行构建miRNA-mRNA和IncRNA-miRNA-mRNA网络.结果 差异表达mRNAs主要富集于炎症反应相关通路.131个差异基因显著富集在PD-1/PD-L1信号通路,发现调控PD-1/PD-L1信号通路的 TLR2、LAT 和 CD247 等靶基因,以及参与调控的 miRNA(hsa-miR-370-3p、hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-4488).初步发现 lncRNA(TCONS-0026560、TCONS-00234402、TCONS-00260914、TCONS-00265581、TCONS-00360886)通过竞争性抑制 miRNA(hsa-miR-370-3p、hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-4488)参与调控TLR2、LAT和CD247表达.结论 PD-1/PD-L1通路在启动和促进免疫抑制中发挥的重要作用,为脓毒症的治疗确定新的目标和治疗靶点.

关键词

脓毒症/微小RNA/长链非编码RNA/二代测序/PD-1/PD-L1

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出版年

2024
中华急诊医学杂志
中华医学会

中华急诊医学杂志

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.556
ISSN:1671-0282
参考文献量25
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