昆虫学报2022，Vol.65Issue(4) ：451-459.DOI:10.16380/j.kcxb.2022.04.005

高桥仁蚧线粒体全基因组测序与分析

Sequencing and analysis of the complete mitochondrial genome of Aclerda takahashii(Hemiptera:Aclerdidae)

邓鋆 王刚 卢聪聪 张江涛 黄晓磊
昆虫学报2022，Vol.65Issue(4) ：451-459.DOI:10.16380/j.kcxb.2022.04.005
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高桥仁蚧线粒体全基因组测序与分析

Sequencing and analysis of the complete mitochondrial genome of Aclerda takahashii(Hemiptera:Aclerdidae)

邓鋆 1王刚 1卢聪聪 1张江涛 2黄晓磊1
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作者信息

  • 1. 福建农林大学植物保护学院,闽台作物有害生物生态防控国家重点实验室,福州350002
  • 2. 江西农业大学林学院,鄱阳湖流域森林生态系统保护与修复国家林业和草原局重点实验室,南昌330045
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摘要

[目的]测定和分析半翅目(Hemiptera)仁蚧科(Aclerdidae)首个线粒体全基因组——高桥仁蚧Aclerda takahashii线粒体全基因组序列,并探讨与其他蚧虫类群的系统发育关系.[方法]基于Illumina测序技术进行高桥仁蚧线粒体全基因组测序,并进行生物信息学分析;基于已报道的15科31种半翅目昆虫的线粒体全基因组序列运用最大似然法(ML)和贝叶斯推断法(BI)构建半翅目系统发育树.[结果]高桥仁蚧线粒体基因组全长16 599 bp,AT含量高达84.51％.在该线粒体基因组中,缩减tRNA非常普遍,10个tRNA缺失二氢尿嘧啶(DHU)臂或TΨC臂,tRNAser(S1)和tRNAser(S2)缺失DHU臂和TΨC臂.系统发育树显示,与仁蚧科亲缘关系最近的是蚧科(Coccidae).[结论]本研究报道了首个仁蚧科的线粒体基因组,发现在高桥仁蚧线粒体基因组中存在普遍的tRNA缺臂现象,为进一步系统地研究蚧虫线粒体基因组提供了数据支持.

关键词

半翅目/仁蚧科/高桥仁蚧/线粒体基因组/缩减tRNAs/系统发育

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基金项目

国家自然科学基金(31970446)

国家重点研发计划(2016YFE0203100)

出版年

2022
昆虫学报
中国科学院动物研究所,中国昆虫学会

昆虫学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.756
ISSN：0454-6296
被引量2
参考文献量3
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