昆虫学报2022,Vol.65Issue(9) :1075-1089.DOI:10.16380/j.kcxb.2022.09.001

西伯利亚蝗卵发育过程的比较转录组分析及滞育关联基因筛选

Comparative transcriptome analysis and screening of diapause-associated genes during the egg development of Gomphocerus sibiricus(Orthoptera:Acrididae)

赵娜 吕雪峰 扈鸿霞 宋余 蒋思涵 季荣 叶小芳
昆虫学报2022,Vol.65Issue(9) :1075-1089.DOI:10.16380/j.kcxb.2022.09.001

西伯利亚蝗卵发育过程的比较转录组分析及滞育关联基因筛选

Comparative transcriptome analysis and screening of diapause-associated genes during the egg development of Gomphocerus sibiricus(Orthoptera:Acrididae)

赵娜 1吕雪峰 2扈鸿霞 1宋余 1蒋思涵 1季荣 1叶小芳1
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作者信息

  • 1. 新疆师范大学生命科学学院,中亚区域跨境有害生物联合控制国际研究中心,新疆特殊环境物种保护与调控生物学实验室,乌鲁木齐830054
  • 2. 新疆畜牧科学院畜牧业质量标准研究所,乌鲁木齐830000
  • 折叠

摘要

[目的]通过筛选西伯利亚蝗Gomphocerussibiricus卵滞育基因及代谢通路,初步明确西伯利亚蝗卵滞育分子机理.[方法]利用Illumina NovaSeq 6000测序平台对西伯利亚蝗早期发育(ES)、滞育(DS)和滞育后发育阶段(PS)的卵进行转录组测序;采用GO和KEGG富集分析并结合文献,预测滞育相关通路并聚类热图分析,筛选蝗卵滞育关联基因,并选取其中6个重要基因进行qRT-PCR验证.[结果]DSvsES和PSvsDS两比较组分别富集到12 419和4 789个差异表达基因,且多上调表达;两比较组共表达差异基因为2 206个,主要与糖代谢、环境胁迫和生长发育相关.DS vs ES组富集最显著的GO条目为蛋白结合,PSvsDS组GO条目主要包含酶活性、细胞骨架构建及蛋白结合等过程.滞育关联基因主要集中在Wnt信号通路、胰岛素信号通路、细胞周期通路以及昆虫激素生物合成等通路.6个重要的滞育关联基因的表达量变化趋势与转录组数据结果基本一致.[结论]本研究初步明确了西伯利亚蝗卵滞育调控的重要代谢途径,并筛选出20个滞育关联基因,为后续深入研究该物种的适应机理奠定了基础.

关键词

西伯利亚蝗//转录组/滞育关联基因/KEGG/qRT-PCR

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基金项目

新疆维吾尔自治区杰出青年科学基金(2021DO1E18)

新疆维吾尔自治区天山英才计划()

新疆维吾尔自治区高等学校科研计划自然科学研究重点项目(XJEDU2021I022)

新疆师范大学校级重点学科生物学学科建设项目()

出版年

2022
昆虫学报
中国科学院动物研究所,中国昆虫学会

昆虫学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.756
ISSN:0454-6296
被引量1
参考文献量21
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