摘要
[目的]基于形态学鉴定和分子生物学技术确认甘薯凹胫跳甲Chaetocnema confinis 是否入侵中国大陆,测定甘薯凹胫跳甲线粒体基因组序列,分析基因组结构及其系统发育关系.[方法]应用显微镜观察从广东不同地点采集的甘薯凹胫跳甲成虫的形态特征,并扩增cox1基因DNA序列进行分子鉴定;利用Illumina MiSeq测序平台对甘薯凹胫跳甲线粒体基因组进行测序、拼装、注释和特征分析;基于亲缘关系相近种属的线粒体基因组序列进行共线性分析和构建系统发育树,分析基因重排和系统发育关系.[结果]形态和分子鉴定结果表明大陆甘薯上发现的跳甲为甘薯凹胫跳甲.甘薯凹胫跳甲线粒体基因组序列大小为15 685 bp,包括有13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因和1个非编码控制区;这37个基因之间排列紧凑,间隔总长度101 bp,排列顺序与模式昆虫Drosophila yakuba线粒体基因排列顺序相同.甘薯凹胫跳甲线粒体基因组A+T含量为77.3％,具有明显的AT偏向性.13个蛋白质编码基因的起始密码子均为ATN.在22个tRNA基因中除tmS1的DHU臂缺失,trnD,trnG,trnN和trnT的二级结构中缺少TψC环外,其余17个都能形成典型的三叶草式二级结构,另trnK的反密码子突变为UUU,trnS1的反密码子突变为UCU.甘薯凹胫跳甲的控制区片段长度仅有60 bp,是目前已报道的昆虫线粒体基因组中最短的控制区.基于线粒体基因组的系统发育分析表明,甘薯凹胫跳甲与跳甲亚科(Alticinae)黄曲条跳甲Phyllotreta striolata亲缘关系最近.[结论]甘薯凹胫跳甲已经入侵到中国大陆.本研究获得了甘薯凹胫跳甲的线粒体基因组序列,为防控甘薯凹胫跳甲和分析叶甲科(Chrysomelidae)各种属间的系统发育关系奠定了基础.
基金项目
广东省甘薯马铃薯产业技术体系建设项目(2021KJ111)
国家甘薯产业技术体系建设项目(CARS-10)
维普
万方数据