昆虫学报2022，Vol.65Issue(12) ：1615-1622.DOI:10.16380/j.kcxb.2022.12.007

黑腹果蝇头部中RNA结合蛋白RBP9的互作蛋白筛选

Screening of the interacting proteins of RNA-binding protein RBP9 in the head of Drosophila melanogaster

时佳园 马达 顾佳蕙 秦笙 汪生鹏 张国政 李木旺 孙霞
昆虫学报2022，Vol.65Issue(12) ：1615-1622.DOI:10.16380/j.kcxb.2022.12.007
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黑腹果蝇头部中RNA结合蛋白RBP9的互作蛋白筛选

Screening of the interacting proteins of RNA-binding protein RBP9 in the head of Drosophila melanogaster

时佳园 1马达 1顾佳蕙 1秦笙 2汪生鹏 2张国政 2李木旺 2孙霞2
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作者信息

  • 1. 江苏科技大学生物技术学院,江苏镇江212018
  • 2. 江苏科技大学生物技术学院,江苏镇江212018;中国农业科学院蚕业研究所,江苏镇江212018
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摘要

[目的]筛选RNA结合蛋白RBP9在黑腹果蝇Drosophila melanogaster头部中的互作蛋白.[方法]利用CRISPR/Cas9基因组编辑技术,分别将3 x Flag和V5标签编码序列插入到黑腹果蝇成虫头中RBP9和FNE基因起始密码子ATG的后面,构建黑腹果蝇转基因品系3×Flag-RBP 9/3 x Flag-RBP9(3FRBP9)和V5-FNE/V5-FNE(VFNE);利用免疫沉淀和质谱法鉴定黑腹果蝇3FRBP9和野生型品系成虫头部中RBP9的互作蛋白并进行生物信息学分析.利用免疫共沉淀方法检测RBP9与FNE蛋白之间的相互作用.[结果]质谱法从黑腹果蝇成虫头部共鉴定了 190个与RBP9相互作用的蛋白,其中包括ELAV和FNE.KEGG富集分析显示这些蛋白的基因主要参与核糖体、碳代谢、三羧酸循环、氨基酸生物合成等通路.免疫共沉淀实验结果验证了 RBP9与FNE蛋白之间存在相互作用.[结论]RNA结合蛋白ELAV家族成员在黑腹果蝇成虫头部中具有相互作用.本研究为RBP9在果蝇神经系统发育中的功能研究提供了重要实验依据.

关键词

黑腹果蝇/RNA结合蛋白/基因表达/质谱分析/转录后调控

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基金项目

出版年

2022
昆虫学报
中国科学院动物研究所,中国昆虫学会

昆虫学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.756
ISSN：0454-6296
被引量1
参考文献量36
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