蛋白质必须通过与其它蛋白质之间的相互作用才能行使其功能，因此，对蛋白质相互作用的研究显得尤为重要。针对蛋白质相互作用的预测问题，文中选取DIP数据库中21034对酵母蛋白进行蛋白质相互作用预测，以四个基于网络拓扑结构的相互聚类系数(Jaccard Index、Meet/Min、Geometric 和 Hypergeometric)和基于相互作用一般性的IG2( New Interaction Generality)算法作为预测蛋白质相互作用的五个属性，并利用Weka中朴素贝叶斯分类法计算蛋白质相互作用网络在这五种属性共同作用下的准确值。并将实验结果与蛋白质生物学特征同源(Homologs)、基因本体GO (Molecular Function、Biological Process和Cellular Component)属性相比较，得出本实验方法具有可行性，给蛋白质相互作用的预测带来指导意义。
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