临床医药文献电子杂志2020，Vol.7Issue(5) ：4-5.

人CDK9基因启动子区结合蛋白的生物信息学分析

Bioinformatics Analysis of Transcription Factor Binding Site in the Promoter of Human CDK9 Gene

蔡洁怡 朱其伟 宗陈雨 刘洪鑫 高兢望 王宇蝶 杜冠魁
临床医药文献电子杂志2020，Vol.7Issue(5) ：4-5.
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人CDK9基因启动子区结合蛋白的生物信息学分析

Bioinformatics Analysis of Transcription Factor Binding Site in the Promoter of Human CDK9 Gene

蔡洁怡 1朱其伟 2宗陈雨 1刘洪鑫 1高兢望 1王宇蝶 1杜冠魁2
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作者信息

  • 1. 海南医学院临床学院,海南海口 571199
  • 2. 海南医学院基础医学和生命科学学院生化与分子生物学教研室,海南海口 571199
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摘要

目的 对人CDK9基因启动子区结合蛋白进行生物信息学分析.方法 从GeneBank数据库中获取人CDK9基因5'调控区,使用在线软件JASPAR对该序列可能存在的转录因子结合位点进行预测.结果 Relative profile score threshold在85％、90％、95％和100％时,该序列存在2365、686、185和13个可能的转录因子结合位点,包含ELK4,Gabpa,Gata1,MZF1,Pdx1,Prrx2,SPI1,ZEB1等.结论 人CDK9基因5'调控区存在多种转录因子的结合位点,这些转录因子大多与肿瘤发生和氧化应激等有关.

关键词

人CDK9基因/启动子/5'调控区/转录因子结合位点

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基金项目

海南医学院2016年校级大学生创新创业训练计划项目(HYCX2016078:)

2017年海南省大学生创新创业训练计划项目(2017121)

出版年

2020
临床医药文献电子杂志

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ISSN：
参考文献量4
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