摘要
目的 识别起病于儿童期的1 型糖尿病(T1DM)及2 型糖尿病(T2DM)的核心基因,并与成人期作比较,以寻找可能的致病核心基因.方法 下载GSE9006 和GSE7014 数据,应用R包鉴别差异基因.采用DAVID数据库进行GO和KEGG分析;应用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络.使用MCODE插件提取核心自网络识别hub基因,并绘制受试者工作特征(ROC)曲线.结果 儿童T1DM差异基因88 个,上调表达36 个,下调表达52 个;儿童T2DM差异基因68 个,上调表达33 个,下调表达35 个;两者共有相同的差异基因 19 个.儿童期糖尿病共同的KEGG信号通路为:细胞因子-细胞因子受体相互作用;TNF信号通路;趋化因子信号通路;NOD样受体信号通路.儿童期T1DM和T2DM的hub基因分别为趋化因子配体1(CXCL1)和趋化因子2(CCL2),ROC曲线下面积分别为0.85 和0.77.结论 通过生物信息学分析发现,儿童期T1DM、T2DM的CXCL2 和CCL2 基因可能是儿童糖尿病的hub基因,具有诊断和预测发病的作用.
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