摘要
目的 利用转录组测序技术,筛选重组人甲状旁腺素(1-34)[rhPTH(1-34)]影响角质形成细胞(KC)内表皮生长因子受体(EGFR)表达的差异转录因子,以探讨rhPTH(1-34)治疗银屑病的机制.方法 慢病毒转染培养的HaCaT细胞,使之过表达EGFR.rhPTH(1-34)组加入0.01μmol/L rhPTH(1-34),空白组加入等量DMEM溶液.抽提两组细胞RNA,用紫外吸收测定法和变性琼脂糖凝胶电泳法进行RNA产量和质量检测.合成cDNA,实时定量PCR扩增,对文库有效浓度进行准确定量.上机测序,对所得数据进行处理和分析.用DESeq2软件分析两组数据之间的差异,以|log2 foldchange|≥1且P<0.05作为筛选条件对测序结果进行分析.结果 rhPTH(1-34)组和空白组共表达的基因数目12455个,rhPTH(1-34)组单独表达421个,空白组单独表达461个.rhPTH(1-34)组与空白组比较,差异基因共185个,其中108个上调,77个下调.下调中,|log2 foldchange|最高的5个差异转录因子为ZNF525、ZNF774、ZNF576、ZBTB42和POU4F1(P<0.05).其中ZNF774、POU4F1主要涉及Notch2、MAPK信号通路的调节.结论 rhPTH(1-34)抑制KC增殖可能与下调ZNF525、ZNF774、ZNF576、ZBTB42、POU4F1表达有关.其中ZNF774、POU4F1可能与KC增殖相关.
基金项目
国家自然科学基金(81703151)
上海市卫生健康委青年科研项目(20214Y0404)
浦东新区卫生系统学科建设计划(PWZzb2022-01)
公利医院青年基金(2020YQNJJ-12)