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银杏叶绿体基因组密码子使用偏性分析

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利用CodonW等软件,对银杏叶绿体基因组57个基因密码子的使用偏性及其影响因素进行研究.对银杏叶绿体基因组的ENC值、中性绘图、ENC-plot绘图、最优密码子、奇偶偏差、对应性分析的结果表明:影响银杏叶绿体基因组密码子使用偏性的因素,以自然选择压力为主,自身基因变异和碱基组成等也有一定影响.依据ENC值建立高低表达基因库,最终确定UUU、UUG、CUU、GUU、UCA、CCA、ACA、UAU、AAU、CGA、AGA等11个银杏叶绿体基因组的最优密码子.
Codon Usage Bias in Chloroplast Genome of Ginkgo biloba

李薇、王倩、胡晓艳、杜淑辉

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山西农业大学林学院,山西 太谷 030800

银杏 叶绿体基因组 密码子使用偏性 最优密码子 自然选择压力

山西省优秀博士来晋工作奖励项目山西农业大学科技创新项目山西省高等学校科技创新项目

SXYBKY2017422017YJ222019L0369

2021

10.3969/j.issn.1671-3168.2021.06.006

林业调查规划
云南省林业调查规划院 西南地区林业信息中心

林业调查规划

CSTPCD
影响因子：0.45
ISSN：1671-3168
年,卷(期)：2021.46(6)
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