绿洲农业科学与工程2023，Vol.9Issue(1) ：55-63.

牛FABP基因家族鉴定与生物信息学分析

Analysis and Identification of FABP Gene Family by Bioinformatics in Cattle

杨杨 高攀 余乾 马顺平 杨华 赵卓 杨庆勇 代蓉
绿洲农业科学与工程2023，Vol.9Issue(1) ：55-63.
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牛FABP基因家族鉴定与生物信息学分析

Analysis and Identification of FABP Gene Family by Bioinformatics in Cattle

杨杨 1高攀 2余乾 1马顺平 1杨华 1赵卓 3杨庆勇 4代蓉1
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作者信息

  • 1. 新疆农垦科学院/省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室,新疆 石河子 832000
  • 2. 新疆生产建设兵团第九师农(畜)科学研究所,新疆 额敏 834601
  • 3. 新疆农垦科学院/省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室,新疆 石河子 832000;石河子大学动物科技学院,新疆 石河子 832003
  • 4. 新疆农垦科学院/省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室,新疆 石河子 832000;华中农业大学信息学院,湖北 武汉 430070
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摘要

本研究系统分析牛FABP基因家族序列信息,为阐明FABP在脂肪合成与代谢中的作用奠定基础.运用生物信息学方法通过保守结构域搜索鉴定了牛的FABP基因,分析FABP基因理化性质、基因结构、系统进化关系和表达情况等.鉴定到11个FABP基因家族成员,分布在牛的第2、6、7、9、11和14号染色体上,由2或4个外显子组成,编码由127～175个氨基酸残基组成的蛋白质.FABPs不存在信号肽和跨膜结构域,属于亲水性蛋白.进化分析表明家族中同一成员的基因结构和结构域相对保守,氨基酸序列同源性高.蛋白互作分析显示FABPs与PPAR家族、LIPE和NCMAP等与脂肪酸及其衍生物代谢相关的蛋白质联系紧密.FABP家族中各成员的组织表达模式差异较大,其中FABP2、FABP9和FABP12基因表达具有组织特异性.牛FABP基因具有保守的基因结构和蛋白结构,它们可能在脂肪(酸)合成代谢中起着重要作用.

关键词

牛/FABP基因/基因家族/生物信息学/基因功能

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基金项目

新疆生产建设兵团重点领域科技攻关项目(2021AB013)

新疆兵团科技创新人才计划项目(2021CB050)

新疆兵团第九师科技计划项目(2020JS003)

新疆兵团第九师科技计划项目(2021JS002)

出版年

2023
绿洲农业科学与工程

绿洲农业科学与工程

ISSN：
参考文献量4
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