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牛FABP基因家族鉴定与生物信息学分析

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本研究系统分析牛FABP基因家族序列信息,为阐明FABP在脂肪合成与代谢中的作用奠定基础.运用生物信息学方法通过保守结构域搜索鉴定了牛的FABP基因,分析FABP基因理化性质、基因结构、系统进化关系和表达情况等.鉴定到11个FABP基因家族成员,分布在牛的第2、6、7、9、11和14号染色体上,由2或4个外显子组成,编码由127~175个氨基酸残基组成的蛋白质.FABPs不存在信号肽和跨膜结构域,属于亲水性蛋白.进化分析表明家族中同一成员的基因结构和结构域相对保守,氨基酸序列同源性高.蛋白互作分析显示FABPs与PPAR家族、LIPE和NCMAP等与脂肪酸及其衍生物代谢相关的蛋白质联系紧密.FABP家族中各成员的组织表达模式差异较大,其中FABP2、FABP9和FABP12基因表达具有组织特异性.牛FABP基因具有保守的基因结构和蛋白结构,它们可能在脂肪(酸)合成代谢中起着重要作用.
Analysis and Identification of FABP Gene Family by Bioinformatics in Cattle

杨杨、高攀、余乾、马顺平、杨华、赵卓、杨庆勇、代蓉

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新疆农垦科学院/省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室,新疆 石河子 832000

新疆生产建设兵团第九师农(畜)科学研究所,新疆 额敏 834601

石河子大学动物科技学院,新疆 石河子 832003

华中农业大学信息学院,湖北 武汉 430070

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FABP基因 基因家族 生物信息学 基因功能

新疆生产建设兵团重点领域科技攻关项目新疆兵团科技创新人才计划项目新疆兵团第九师科技计划项目新疆兵团第九师科技计划项目

2021AB0132021CB0502020JS0032021JS002

2023

绿洲农业科学与工程

绿洲农业科学与工程

ISSN:
年,卷(期):2023.9(1)
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