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秦皇岛口岸褐家鼠携带汉坦病毒S基因序列分析

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目的 了解河北省秦皇岛口岸褐家鼠携带汉坦病毒情况及其基因型.方法 褐家鼠标本于2016年7月28日采自河北省秦皇岛港渤海船务有限公司货堆区和生活区,运用实时荧光PCR检测标本汉坦病毒核酸并进行核苷酸同源性和进化树分析.结果 从1只褐家鼠中检测到汉坦病毒核酸阳性,经汉坦病毒S基因序列测定和同源性分析,与国内外汉城型(SEO型)汉坦病毒相似性较高(87.3%~97.9%),与汉滩型(HTN型)汉坦病毒及其他类型汉坦病毒相似性较低(<55%).系统进化树显示该病毒株与SEO型汉坦病毒汇聚一支,且与S3亚型在同一分支,与辽宁省褐家鼠中的病毒株亲缘关系最近.结论 河北省秦皇岛口岸褐家鼠携带的汉坦病毒SEO型为S3亚型,与河北省所流行的汉坦病毒种类一致.
S gene sequence analysis of Hantavirus carried by the Rattus norvegicus from Qinhuangdao port

李云、史玲莉、刘荐男、闫冀焕、聂维忠、刘淑萍

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河北国际旅行卫生保健中心,石家庄050091

河北省食品检验研究院,石家庄050000

秦皇岛出入境检验检疫局,河北秦皇岛066004

褐家鼠 汉坦病毒 实时荧光聚合酶链式反应 S基因

2017

10.11853/j.issn.1003.8280.2017.05.021

媒介
中国轻工业联合会

媒介

ISSN：1007-0923
年,卷(期)：2017.28(5)
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