烟草祖先种及重要野生种叶绿素酶基因CLH1的生物信息学分析

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中文摘要：叶绿素酶(Chlorophyllase)是所有光合生物叶绿素代谢中最重要的酶之一。叶绿素酶催化叶绿素的水解，产生脱植基叶绿素和叶绿醇。以烟草祖先种和重要野生种为研究对象，以拟南芥CHLOROPHYLLASE 1(CLH1)为探针，通过同源序列搜索，从数据库中获取普通烟草(Nicotiana tabacum)及祖先种、烟草属重要野生种中的CLH1基因及其蛋白序列，并通过生物信息学分析手段对其编码蛋白的理化特性、氨基酸序列特征、蛋白结构与功能、启动子序列及表达调控特征进行了分析，并以林烟草(Nicotiana sylvestris)NsylCLH1为代表，预测了该基因启动子的顺式作用元件，以渐狭叶烟草(Nicotiana attenuata)NattCLH1为例，预测了该基因的编辑位点。结果表明，栽培烟草CLH1蛋白虽在理化特性上存在差异，但氨基酸序列分析表明这些序列高度相似;对林烟草NsylCLH1基因的启动子顺式作用元件分析显示，除光响应作用元件、抗病性作用元件、干旱和盐分等作用元件，还有与茉莉酸甲酯(Methyl jasmonate，MeJA)、赤霉素(Gibberellic acid，GA)、脱落酸(Abscisic acid，ABA)和水杨酸(Salicylic acid，SA)等激素响应相关的元件，表明NsylCLH1基因的表达水平受多种因素的影响。最后，基因编辑位点预测显示渐狭叶烟草NattCLH1可能跨越外显子-外显子连接。为茄科烟草属植物CLH1基因的功能研究、基因编辑及品质育种等提供了理论基础。

外文标题：Bioinformatics Analysis of Chlorophyllase Gene CLH1 in Tobacco Ancestor Species and Important Wild Species

作者：

赵晨颖、李晓、梁淼、侯佩

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作者单位：

郑州轻工业大学食品与生物工程学院,河南郑州 450000

关键词：

普通烟草祖先种重要野生种叶绿素酶基因生物信息学分析

基金：

郑州轻工业大学博士科研基金河南省科技特派员项目

项目编号：

2015BSJJ020SPY20180015

出版年：

2022

DOI：

10.16693/j.cnki.1671-9646(X).2022.02.045

农产品加工(下半月)

山西省农业机械化科学研究院山西省农产品加工装备技术管理站山西省农业产业化协会

农产品加工(下半月)

影响因子：0.209

ISSN：1671-9646

年,卷(期)：2022.(2)

参考文献量15