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一株罗非鱼无乳链球菌Streptococcus agalactiae CS2108的全基因组测序及功能分析

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无乳链球菌是罗非鱼的主要病原菌,给水产养殖业带来严重的经济损失.实验室前期从罗非鱼肝脏组织中分离到1株罗非鱼无乳链球菌,命名为Sreptococcus agalactiae CS2108.深入研究罗非鱼无乳链球菌S.agalactiae CS2108的致病机制,为有效防治无乳链球菌病提供理论支撑.采用Illumina Hiseq+PacBio的测序方法获得S.agalactiae CS2108基因组完成图,进一步对测序数据进行基因组组装、预测与功能注释,并在相应数据库预测毒力因子和耐药基因.S.agalactiae CS2108基因组包含1条染色体和1个质粒,染色体大小为2189951 bp,质粒大小为4440 bp;序列已提交至GenBank数据库,登录号分别为CP123969、CP123970;含有8个基因组岛,2个前噬菌体和6个CRISPR-Cas序列;得到248个毒力因子和141个耐药基因.报道这株罗非鱼无乳链球菌的全基因组序列,分析其基因功能,为后续罗非鱼无乳链球病的防治提供理论基础.

施金谷、马振花、王志强、韩书煜、罗福广、文衍红、易弋、苏在权、佀再勇

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罗非鱼 无乳链球菌 全基因组测序 基因组功能

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南方农业
重庆市农业科学院

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影响因子：0.596
ISSN：1673-890X
年,卷(期)：2024.18(5)
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