摘要
托盘青冈(Quercus patelliformis),作为青冈亚属植物中的一种代表植物,有着巨大的经济价值.目前,关于托盘青冈叶绿体基因组的研究还未见报道.为有助于该物种的分子鉴定,首次报道了托盘青冈叶绿体基因组结构与特征:托盘青冈叶绿体全基因组全长为160 910 bp,GC含量占基因总数的36.90%;其叶绿体基因组由1个大的单拷贝区(LSC,90 236 bp),1个小的单拷贝区(SSC,18 992 bp)和1对逆向重复区(IRs,各25 841 bp)组成;托盘青冈明显偏好以A/U结尾的密码子;此外,共检测到116个简单重复序列(SSR)和45个散在重复序列.在将托盘青冈与其他青冈亚属植物进行比较分析时发现,它们的叶绿体基因组总体上比较保守,IR/SC边界没有明显的收缩和扩展;还发现了4个高变异热点,分别是trnK-rps16、trnF-ndhJ、rbcL-accD和ycf1.系统发育分析显示,托盘青冈属于青冈亚属植物,且与赤皮青冈(Quercus gilva)有较近的亲缘关系.
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