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全基因组测序技术研究及其在木本植物中的应用
全基因组测序技术研究及其在木本植物中的应用
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中文摘要:
基因组序列是开展遗传研究重要的信息基础,随着测序技术飞速发展至第3代长片段测序方法,测序读长历经从几十到数万个碱基的提升,对进一步提升基因组组装的完整度以及准确性提供了极大的裨益.现已完成了大量植物种全基因组测序工作,其中木本植物有40多个,还有更多树种的全基因组测序正在进行之中.针对各类测序技术的基因组组装及后续分析,研究人员也开发了大量的生物信息学工具.笔者从测序技术、基因组装技术和全基因组测序生物信息学分析等方面,罗列了目前已完成全基因组测序的木本植物,介绍了全基因组测序技术的发展与应用,以及适用于第3代数据基因组组装的生物学分析软件,为林木基因组研究者提供一定的借鉴.
外文标题:
Progress on the whole genome sequencing and the application in woody plants
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作者:
刘海琳、尹佟明
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作者单位:
南京林业大学,南方现代林业协同创新中心,江苏 南京210037
关键词:
木本植物
全基因组测序
测序技术
基因组装技术
生物信息学分析
基金:
国家自然科学基金
项目编号:
31570662
出版年:
2018
南京林业大学学报(自然科学版)
南京林业大学
南京林业大学学报(自然科学版)
CSTPCD
CSCD
北大核心
影响因子:
1.012
ISSN:
1000-2006
年,卷(期):
2018.
42
(5)
被引量
7
参考文献量
3