南京林业大学学报(自然科学版)2021,Vol.45Issue(1) :36-44.DOI:10.12302/j.issn.1000-2006.201911038

大青杨PuZFP 103基因的序列特征及逆境胁迫的表达分析

Sequence characteristics and expression pattern analyses of PuZFP 103 gene under abiotic stress in Populus ussuriensis

张馨 马苗苗 吕婉秋 LEE Joobin 杨静莉
南京林业大学学报(自然科学版)2021,Vol.45Issue(1) :36-44.DOI:10.12302/j.issn.1000-2006.201911038

大青杨PuZFP 103基因的序列特征及逆境胁迫的表达分析

Sequence characteristics and expression pattern analyses of PuZFP 103 gene under abiotic stress in Populus ussuriensis

张馨 1马苗苗 1吕婉秋 1LEE Joobin 1杨静莉1
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作者信息

  • 1. 东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室,黑龙江 哈尔滨 150040
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摘要

[目的]通过研究大青杨(Populus ussuriensis)PuZFP 103基因的序列特征及其在不同组织部位、激素处理与胁迫应答中的表达特性,为揭示PuZFP 103在大青杨生长发育中的功能提供依据.[方法]利用各种生物信息学方法对PuZFP 103基因进行分析,采用实时荧光定量PCR(real time quantitative polymerase chain reaction,RT-qpCR)技术分析PuZFP 103基因在不同组织、激素处理与胁迫应答中的表达模式,并用基因枪轰击法进行亚细胞定位分析.[结果]生物信息学分析发现,PuZFP 103CDS序列全长504 bp,编码168个氨基酸.分析得出PuZFP103蛋白含有ZnF-C2H2结构域,其二级结构中α螺旋、无规则卷曲和β-折叠分别占24%、84%和1%.进化树构建图显示,其与同属毛果杨、胡杨、毛白杨及番木瓜聚类到一起,亲缘关系最近.RT-qPCR分析结果显示,NaCl、脱落酸(abscisic acid,ABA)和PEG 6000胁迫处理后PuZFP 103基因在大青杨叶和根中的表达量在大多数时间内相对于未处理都有所提高.另外,PuZFP 103基因定位于细胞核中.[结论]PuZFP 103基因在NaCl、ABA和PEG 6000胁迫处理后呈正调控的应答模式,可能参与了大青杨对渗透胁迫的代谢途径或信号传导,属于逆境胁迫下的调控因子.本研究初步证明大青杨PuZFP 103基因与胁迫响应相关,但是关于其信号传导与调控机制需进一步研究.

关键词

大青杨/PuZFP/103基因/逆境胁迫/生物信息学/RT-qPCR

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基金项目

国家自然科学基金面上项目(31870649)

出版年

2021
南京林业大学学报(自然科学版)
南京林业大学

南京林业大学学报(自然科学版)

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.012
ISSN:1000-2006
参考文献量13
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