南京林业大学学报(自然科学版)2021，Vol.45Issue(2) ：35-42.DOI:10.12302/j.issn.1000-2006.202008048

33个杨柳品种指纹图谱构建

Construction of fingerprints for 33 varieties in Salicaceae

何旭东 郑纪伟 孙冲 何开跃 王保松
南京林业大学学报(自然科学版)2021，Vol.45Issue(2) ：35-42.DOI:10.12302/j.issn.1000-2006.202008048
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33个杨柳品种指纹图谱构建

Construction of fingerprints for 33 varieties in Salicaceae

何旭东 1郑纪伟 1孙冲 2何开跃 3王保松1
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作者信息

  • 1. 江苏省林业科学研究院,江苏 南京 211153;江苏省农业种质资源保护与利用平台柳树资源圃,江苏 南京 211153
  • 2. 江苏省农业种质资源保护与利用平台柳树资源圃,江苏 南京 211153;南京林业大学生物与环境学院,江苏 南京 210037
  • 3. 南京林业大学生物与环境学院,江苏 南京 210037
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摘要

[目的]构建杨树与柳树优良品种的指纹图谱,对不同品种进行准确鉴定.[方法]利用柳树EST-SSR标记对33个杨树与柳树优良品种进行通用性检测及基因分型,通过核心引物间的组合构建品种指纹图谱.同时采用非加权组平均法进行聚类,分析各品种间亲缘关系.[结果]12个EST-SSR标记共扩增出97条等位片段,每个位点等位基因数5～13个不等,平均为8.1个.12个位点的多态信息含量(PIC)变化范围为0.637 2～0.834 8,平均为0.781 7.优选的3对核心引物中,SALeSSR0340与SALeSSR0346组合可完全区分12个杨树品种,而SALeSSR0259、SALeSSR0340与SALeSSR0346的组合可完全区分所有的33个品种.聚类分析显示33个品种间的遗传相似系数为0.68～0.96,并分成杨属与柳属两大类,与传统的杨柳科系统分类学一致.各品种间亲缘关系聚类结果与遗传背景相吻合.[结论]对33个杨柳树优良品种进行指纹图谱构建与亲缘关系分析,表明EST-SSR标记可有效反映品种间的差异,建立的基因分型体系准确、高效,可为杨树与柳树品种鉴定、保护与推广工作提供科学依据.

关键词

杨树/柳树/SSR标记/指纹图谱/亲缘关系/基因分型

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基金项目

江苏省林业科学研究院自主科研项目(BM2018022-01)

江苏省林业科学研究院青年基金(JAF-2016-01)

出版年

2021
南京林业大学学报(自然科学版)
南京林业大学

南京林业大学学报(自然科学版)

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.012
ISSN：1000-2006
被引量5
参考文献量11
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