首页|山桐子IpSAD基因家族分析及功能鉴定

山桐子IpSAD基因家族分析及功能鉴定

扫码查看
原文链接
  • 国家科技期刊平台
  • NETL
  • NSTL
  • 万方数据
  • 维普
[目的]硬脂酰-ACPΔ9脱氢酶(stearoyl-ACPΔ9 desaturase,SAD)是决定脂肪酸组成的关键酶,分离和鉴定木本油料植物山桐子(Idesia polycarpa)的SAD基因,可为遗传改良山桐子油的脂肪酸组成提供基因资源.[方法]使用HMM和Blastp鉴定山桐子全基因组中的SAD家族成员;利用MEGA X、MEME和PlantCare等在线软件对其蛋白质理化性质、系统发育关系、基因结构、保守基序和启动子顺式调控元件等进行分析;使用MCSCANX分析山桐子和毛果杨SAD基因之间的共线性关系;基于RNA-seq数据,分析IpSAD各成员的表达模式,通过病毒诱导的基因沉默技术(virus induced gene silencing,VIGS)快速验证它们的生物学功能.[结果]①在山桐子基因组中共鉴定到7个IpSAD基因(IpSAD1～7),多重序列比对结果显示各成员间序列相似度较高且结构域保守;②系统发育分析表明,IpSAD成员可以分为3个亚组,与拟南芥SAD家族的分类结果一致,拟南芥单不饱和油酸合成关键基因AtSSI2与山桐子IpSAD2、IpSAD3、IpSAD4的亲缘关系较近;③启动子区域顺势调控元件预测结果显示IpSAD基因的启动子含有光反应、脱落酸响应等顺式调控元件;④IpSAD基因按其组织表达模式可分为3类,第1类和第2类成员在大部分组织中表达量较低,而第3类成员在所有组织中表达量均较高.⑤沉默IpSAD基因使叶片的油酸含量显著降低,其中IpSAD3的沉默可使油酸含量下降76％.[结论]明确了IpSAD家族各成员的基本特征,确定了它们对于油酸合成的生物学功能,并为山桐子油脂生物合成调控机制研究奠定了基础.
Characterization of IpSAD gene family in Idesia polycarpa and functional identification

龚珏、毕浩、杨雯露、王东明、王乐辉、姜渊忠、马涛

展开 >

四川大学生命科学学院,四川 成都 610064

四川省资阳市雁江区农业农村局,四川 资阳 641300

四川丹桐科技有限公司,四川 成都 610014

山桐子 硬脂酰-ACP Δ9 油酸 病毒诱导基因沉默

2021YFD220110031922061

2022

10.12302/j.issn.1000-2006.202207034

南京林业大学学报(自然科学版)
南京林业大学

南京林业大学学报(自然科学版)

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.012
ISSN：1000-2006
年,卷(期)：2022.46(6)
  • 1
  • 3