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肉果类作物ULT基因的鉴定和表达分析

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[目的]本文旨在鉴定具有代表性的肉果类作物中的ULTRAPETALA(ULT)基因,分析其序列特征以及表达模式,为研究ULT基因在肉果类作物果实发育中的功能奠定基础.[方法]运用生物信息学的方法,从全基因组水平对19种作物(包括13种肉果类作物)的ULT基因进行鉴定,分析其进化关系、蛋白理化性质、蛋白保守基序、外显子/内含子结构和启动子元件等;利用公共转录组数据,分析ULT基因在不同组织中的表达模式以及番茄SlULT1在3种果实成熟突变体中的表达情况;运用实时荧光定量PCR技术,分析番茄SlULT1在不同组织中的表达水平和对乙烯的响应.[结果]19个物种中有18个物种只含有1～3个ULT基因,而荠蓝有5个ULT基因.不同物种中ULT的蛋白保守基序和外显子/内含子组成非常相似.ULT基因启动子区域含有大量光、激素和非生物胁迫响应元件.ULT基因在不同物种的不同组织中均有表达,尤其是在肉果类作物果实中也有很高的表达.番茄中SlULT1的表达量随着果实的成熟逐渐增加,并且受乙烯的诱导;在番茄rin、cnr和nor这3种果实成熟突变体中SlULT1的表达受到抑制.[结论]ULT基因在物种进化中相对保守,ULT基因除了已知的调控根、茎、叶和花的发育之外,还调控肉果类作物果实的发育和成熟.在番茄中SlULT1通过RIN、NOR和CNR基因以及乙烯的调控来参与果实的成熟过程.
Identification and expression analysis of ULT genes in fleshy fruit crops

薛娟、丁强强、杨欣欣、皮颖、李义、吴寒

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南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室/园艺学院,江苏 南京210095

ULT基因 肉果类作物 果实发育和成熟 生物信息分析 表达分析

江苏高校优势学科建设工程项目

2021

10.7685/jnau.202003026

南京农业大学学报
南京农业大学

南京农业大学学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.939
ISSN：1000-2030
年,卷(期)：2021.44(1)
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