南京农业大学学报2021，Vol.44Issue(6) ：1074-1082.DOI:10.7685/jnau.202102013

辣椒胶孢炭疽菌CFEM效应因子鉴定及转录组分析

Bioinformatic identification and transcriptional analysis of CFEM effectors of Colletotrichum gloeosporioides in pepper

刘思珍 欧阳超 满益龙 盛家伟 陈岳 张鑫 郑立敏 李智强 李大伟 张德咏 刘勇 王运生 谭新球
南京农业大学学报2021，Vol.44Issue(6) ：1074-1082.DOI:10.7685/jnau.202102013
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辣椒胶孢炭疽菌CFEM效应因子鉴定及转录组分析

Bioinformatic identification and transcriptional analysis of CFEM effectors of Colletotrichum gloeosporioides in pepper

刘思珍 1欧阳超 1满益龙 2盛家伟 3陈岳 4张鑫 4郑立敏 4李智强 5李大伟 6张德咏 4刘勇 4王运生 7谭新球1
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作者信息

  • 1. 湖南大学研究生院隆平分院,湖南 长沙410125;湖南省农业科学院植物保护研究所,湖南 长沙410125
  • 2. 湖南省农业科学院生物技术研究所,湖南 长沙410125
  • 3. 湖南省农业科学院植物保护研究所,湖南 长沙410125;湖南农业大学植物保护学院,湖南 长沙410128
  • 4. 湖南省农业科学院植物保护研究所,湖南 长沙410125
  • 5. 中国农业科学院植物保护研究所,北京100193
  • 6. 西北农林科技大学园艺学院,陕西 杨凌712100
  • 7. 湖南农业大学植物保护学院,湖南 长沙410128
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摘要

[目的]本文旨在研究辣椒胶孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides)常见真菌细胞外膜蛋白(common in several fungal extracellular membrane proteins,CFEM)的组成和结构.[方法]以辣椒胶孢炭疽菌CSLL-11的基因组为研究对象,通过生物信息学分析其CFEM效应因子的信号肽、跨膜结构域和亚细胞定位信号等结构特征;利用转录组学途径分析其在病菌与寄主互作过程中的表达特征,并对部分CFEM效应因子进行亚细胞定位分析.[结果]CSLL-11共编码30个CFEM效应因子,其中26个具有信号肽并可分泌至胞外;17个含有数目不等的跨膜结构域.CFEM效应因子Cghn02929、Cghn09727、Cghn12645和Cghn14146在侵染辣椒果实各阶段均具有较高表达水平,推测其可能参与病菌整个侵染过程.Cghn14146、Cghn09727和Cghn13279定位于细胞膜和细胞质,而Cghn02929、Cghn13471定位于细胞核、细胞膜和细胞质.[结论]明确了辣椒胶孢炭疽菌CFEM效应因子的组成和结构特征,探明了CFEM效应因子间的表达水平和亚细胞定位差异.

关键词

辣椒/胶孢炭疽菌/CFEM效应因子/生物信息学分析/亚细胞定位

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基金项目

国家自然科学基金(31972223)

国家自然科学基金青年基金(31701814)

湖南农业科技创新资金项目(2020CX39)

湖南农业科技创新资金项目(2020CX43)

出版年

2021
南京农业大学学报
南京农业大学

南京农业大学学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.939
ISSN：1000-2030
被引量2
参考文献量6
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