南京农业大学学报2021,Vol.44Issue(6) :1125-1134.DOI:10.7685/jnau.202011010

一种新的猪链球菌整合性接合元件的鉴定及环化分析

Identify and cyclization analysis of a novel integrative and conjugative element of Streptococcus suis

何培娟 潘子豪 古其兵 张越 姚火春
南京农业大学学报2021,Vol.44Issue(6) :1125-1134.DOI:10.7685/jnau.202011010

一种新的猪链球菌整合性接合元件的鉴定及环化分析

Identify and cyclization analysis of a novel integrative and conjugative element of Streptococcus suis

何培娟 1潘子豪 1古其兵 1张越 1姚火春1
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作者信息

  • 1. 南京农业大学OIE猪链球菌病参考实验室/动物医学院,江苏 南京210095
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摘要

[目的]本试验以猪链球菌Chz型的2株临床分离株AH681和HN136为研究对象,通过分析鉴定其整合性接合元件(integrative and conjugative element,ICE)和检测其环化活性,探讨猪链球菌ICE与耐药基因转移的关系和多重耐药机制.[方法]采用最小抑菌浓度法测定猪链球菌AH681和HN136的耐药性.建立生物信息学方法预测细菌基因组中整合性接合元件,结合已报道猪链球菌ICE的位置特点对其进行定位;用环化试验和接合试验检测所预测ICE的活性;构建进化树分析猪链球菌中ICE的进化关系.[结果]AH681和HN136均为多重耐药菌株,其基因组中存在明显外源插入的基因岛,其中大小为73 kb和115 kb的基因岛具备整合性接合元件的典型特点,且这2个基因岛对应的ICE(ICESsuAH681和ICESsuHN136)属于ICESa2603家族.进一步分析发现,ICESsuAH681中存在四环素类抗生素耐药基因tet(O)、大环内酯类抗生素耐药基因erm(B)、氟喹诺酮类药物出口ATP接合蛋白基因、细菌素操纵子和砷酸盐还原酶基因等;ICESsuHN136中存在tet(O)、erm(B)和细菌素基因簇等.环化试验证实ICESsuAH681可自主地从基因组上切离并成环,但未在P1/7菌株上获得ICESsuAH681的接合子;未检测到ICESsuHN136的切离和成环.进化分析结果表明猪链球菌中已明确位置的ICE在进化关系上有6个大分支,ICESsuAH681与ICESa2603家族ICE的亲缘关系更近.[结论]猪链球菌Chz型多重耐药菌株AH681中存在1个73 kb的携带tet(O)、erm(B)和arsc等抗性基因的ICESsuAH681,它可从基因组上切除并环化,是一个有环化活性的ICE.

关键词

猪链球菌/耐药性/整合性接合元件/进化分析

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基金项目

江苏省自然科学基金(BK20191309)

上海市科技兴农重点攻关项目(沪农科攻字〔2016〕第6-2-1号)

出版年

2021
南京农业大学学报
南京农业大学

南京农业大学学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.939
ISSN:1000-2030
被引量2
参考文献量25
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