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绵羊miRNA-1185-5p的基因组定位、靶基因预测和功能分析

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miRNAs是一类小分子非编码RNAs,在机体许多生理及病理过程中发挥调控作用.该课题组前期研究发现,miRNA-1185-5p在经产双羔母羊卵巢中表达水平显著低于经产单羔母羊.为进一步深入挖掘miRNA-1185-5p在绵羊生殖过程中的作用,利用生物信息学手段分析了miRNA-1185-5p的基因组定位,预测其靶基因,并对靶基因进行GO功能分析.结果 表明,miRNA-1185-5p是位于绵羊18号染色体的内含子miRNA;利用miRDB和microT2种方法预测获得miRNA-1185-5p的23个靶基因,这些靶基因主要参与细胞增殖、分化和凋亡过程以及代谢等生物学过程,其中,靶基因AhR直接参与生殖过程.该研究说明miRNA-1185-5p可能通过作用于AhR等靶基因对绵羊生殖过程发挥调控作用.
Genomic Location, Target Genes Prediction and Their Function Analysis of miRNA-1185-5p in Sheep

范文斌、祁云霞、刘永斌

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呼和浩特职业学院生物化学工程学院,内蒙古 呼和浩特010051

内蒙古自治区农牧业科学院,内蒙古 呼和浩特010031

miRNA-1185-5p 靶基因 GO功能注释 绵羊

内蒙古自治区高等学校科学研究项目内蒙古自治区自然科学基金国家自然科学基金国家肉羊产业技术体系建设项目

NJZY176482018MS0308231760658CARS-38

2020

畜牧与饲料科学
内蒙古自治区农牧业科学院

畜牧与饲料科学

CSTPCD
影响因子:0.332
ISSN:1672-5190
年,卷(期):2020.41(2)
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