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马早期流产相关功能基因挖掘的研究

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旨在探究与马早期流产相关的功能基因.在同一舍饲马群体中筛选配种后45 d能够检查到胚胎,但2～4个月后发生流产的母马10匹(流产组),以及能正常分娩的母马10匹(分娩组).采集马匹血液样本,提取基因组DNA.全基因组平均测序深度为10×,基因组覆盖度97％以上,每个样本大约测得4×106个SNP.对流产组和分娩组的全基因组重测序数据进行比较.结果表明:通过Fst分析获得1381个SNP位点,π分析获得1614个SNP位点,联合分析得到203个SNP位点;过滤掉突变基因间区域、非编码区域、内含子和同义SNV后得到82个SNP位点,定位于69个基因上;通过GO term、信号通路富集分析以及文献查阅,筛选出其中的12个基因为马早期流产和胚胎着床的重要候选基因,这些候选基因通过参与激素调节、胚胎侵入、维生素合成代谢等影响胚胎着床.研究结果为揭示引起马匹早期流产的原因提供了生物信息学方面的参考.
Discovery of Functional Genes Associated with Mare Early Abortion

吴海青、刘威、马跃军、苏少锋、萨初拉、付绍印、高文渊、李玉荣

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内蒙古自治区农牧业科学院,内蒙古 呼和浩特 010031

内蒙古自治区草原工作站,内蒙古 呼和浩特 010018

马 早期流产 胚胎着床 全基因组重测序 激素调节 维生素合成代谢

内蒙古自治区科技创新引导奖励资金项目

201702066

2021

10.12160/j.issn.1672-5190.2021.01.001

畜牧与饲料科学
内蒙古自治区农牧业科学院

畜牧与饲料科学

CSTPCD
影响因子：0.332
ISSN：1672-5190
年,卷(期)：2021.42(1)
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