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非洲猪瘟病毒pS273R蛋白的生物信息学分析

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[目的]对非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)的pS273R蛋白进行生物信息学分析.[方法]采用生物信息学工具分析 43 株ASFV的pS273R基因序列同源性以及遗传进化关系,预测pS273R蛋白的理化性质、二级结构、磷酸化位点、糖基化修饰、亚细胞定位、三级结构.[结果]不同ASFV毒株的pS273R基因同源性较高,分离自中国的 5 个毒株的pS273R基因序列同源性为 100％,与分离自其他国家的 38 个毒株的pS273R基因序列同源性在 93.60％～100％;系统进化分析表明,中国毒株与欧洲分支的亲缘关系较近.pS273R蛋白由 273 个氨基酸组成,预测大小为 31.58 kDa,是亲水性蛋白;二级结构以α-螺旋(Hh)、延伸链(Ee)、β-转角(Tt)、无规卷曲(Cc)4 种形式为主,含 28 个磷酸化位点和 2 个潜在的N-糖基化位点,在宿主细胞的胞质中存在的可能性最高(P=47.8％);三级结构是由二级结构α-螺旋、β-转角、β-折叠以及无规卷曲等经过旋转、折叠与卷曲等生物过程而形成.[结论]研究结果为pS273R蛋白结构和功能的深入解析以及ASFV抑制剂的研制提供了参考.
Bioinformatics Analysis of African Swine Fever Virus pS273R Protein

赵金兵、王莫离、王铁军、石建州、姚伦广

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南阳师范学院,河南 南阳 473061

南阳农业职业学院,河南 南阳 473000

非洲猪瘟病毒 pS273R蛋白 生物信息学分析

南阳师范学院2023年理工科校级STP项目河南省科技攻关项目河南省高等学校重点科研项目南阳市科技攻关项目

2023STP00622210211026022A180026KJGG136

2023

10.12160/j.issn.1672-5190.2023.02.005

畜牧与饲料科学
内蒙古自治区农牧业科学院

畜牧与饲料科学

CSTPCD
影响因子：0.332
ISSN：1672-5190
年,卷(期)：2023.44(2)
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