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非洲猪瘟病毒pI215L蛋白结构与功能的生物信息学分析

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[目的]研究非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)pI215L蛋白的结构与功能.[方法]从ASFV数据库(The African Swine Fever Virus Database,ASFVdb)下载 29 个不同ASFV毒株的pI215L基因序列,利用生物信息学工具分析不同毒株pI215L基因的同源性及遗传进化关系,预测pI215L蛋白的理化性质、二级结构、线性表位及三维空间位置.[结果]不同ASFV毒株的pI215L基因核苷酸序列同源性较高;pI215L蛋白性质不稳定,亲水性较高,二级结构主要含有α-螺旋、延伸链、β-转角、无规卷曲 4 种形式,含有 1 个E2 泛素化结合酶结构域;共有 16 处肽段是潜在的线性表位;使用SWISS-MODEL对pI215L蛋白的三级结构完成同源建模,在PDB数据库中与 6NYO.1(ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2 和ubiquitin)的同源性达 46.06%;再使用PyMOL软件对pI215L蛋白进行构象表位预测,准确定位预测的表位三维空间位置在模型中的分布.[结论]该研究结果为解析pI215L蛋白的结构和功能以及研制ASFV疫苗和抗ASFV药物提供了参考.
Bioinformatics Analysis on the Structure and Function of African Swine Fever Virus pI215L Protein

African swine fever virusbioinformaticspI215L proteinstructure and function

赵金兵、王铁军、王莫离、石建州、姚伦广

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南阳师范学院,河南 南阳 473061

南阳农业职业学院,河南 南阳 473000

非洲猪瘟病毒 生物信息学 pI215L蛋白 结构与功能

南阳师范学院2023年理工科校级STP项目河南省科技攻关项目河南省高等学校重点科研项目南阳市科技攻关项目

2023STP00622210211026022A180026KJGG136

2023

10.12160/j.issn.1672-5190.2023.04.002

畜牧与饲料科学
内蒙古自治区农牧业科学院

畜牧与饲料科学

CSTPCD
影响因子：0.332
ISSN：1672-5190
年,卷(期)：2023.44(4)
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