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新疆部分地区屠宰场羊源细粒棘球蚴分子鉴定及其遗传多样性分析

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[目的]了解新疆维吾尔自治区部分规模化屠宰场羊的细粒棘球蚴感染情况及其分子遗传特征.[方法]收集屠宰场羊肝脏组织内经肉眼观察鉴定为细粒棘球蚴的包囊样本 96 份,全部提取基因组DNA后,基于细粒棘球绦虫cox1 基因位点和nad1 基因位点进行PCR扩增和测序.通过序列比对数据鉴定其基因型,构建遗传进化树解析其分子遗传特征.[结果]在cox1 基因位点上,有 81 份样本呈PCR扩增阳性(84.37%,81/96),经序列分析鉴定,所有阳性样本均为细粒棘球蚴G1 基因型(n=81),存在 15个单倍型(Hap_1～15);在nad1 基因位点上,有 67 份样本呈PCR扩增阳性 69.79%(67/96),经序列分析鉴定出 2 种基因型,分别为细粒棘球蚴G1 基因型(n=66)和G3 基因型(n=1),存在 19 个单倍型(Hap_1～19).种系发育分析显示,获得的细粒棘球蚴G1 基因型和G3 基因型序列,与国内外已报道的多种宿主源的G1 基因型和G3 基因型序列均处于同一个进化支.[结论]新疆部分地区羊源细粒棘球蚴呈现遗传多样性分布特征,研究结果为该地区羊包虫病的防治提供了基础数据.
Molecular Identification and Genetic Diversity of Echinococcus granulosus Derived from Sheep in Abattoirs in Parts of Xinjiang Uygur Autonomous Region,China

Echinococcus granulosusdetectiongenotypehaplotypesheep

薛文、王凌云、王云峰、张振杰、赵爱云、王甜、齐萌

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塔里木大学动物科学与技术学院/新疆生产建设兵团塔里木动物疫病诊断与防控工程实验室,新疆 阿拉尔843300

新疆维吾尔自治区动物疾病预防控制中心,新疆 乌鲁木齐 830010

细粒棘球蚴 检测 基因型 单倍型 羊

新疆生产建设兵团重点领域科技攻关计划新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室开放课题塔里木大学校长基金

2020AB025HS201907TDZKSS201905

2023

10.12160/j.issn.1672-5190.2023.04.017

畜牧与饲料科学
内蒙古自治区农牧业科学院

畜牧与饲料科学

CSTPCD
影响因子：0.332
ISSN：1672-5190
年,卷(期)：2023.44(4)
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