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清远禾花鲤和华南鲤背部肌肉的转录组分析

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清远禾花鲤是稻渔综合种养的优良品种,具有较高的研究价值.该研究基于Illumina HiSeqTM 2000平台,对清远禾花鲤和华南鲤背部肌肉进行了转录组测序.经de nevo组装,在清远禾花鲤样本中获得39210个Unigene,在华南鲤样品中获得38096个Unigene.共筛选出差异表达基因4395个,其中禾花鲤相对华南鲤表达量上调的基因有4147个,下调的基因有2588个.GO功能富集结果显示,差异表达基因中注释到细胞组分的基因数最多,有2087个;注释到生物学过程基因有2051个;注释到分子功能的基因有890个.SNP分析在清远禾花鲤中鉴定出规格组中共鉴定出172164个SNPs,华南鲤中鉴定出166089个SNPs.此次研究结果为清远禾花鲤分子标记批量开发、功能相关基因挖掘以及分子遗传育种提供了理论数据支撑.

陈金辉、林曼芬、杨虹、于辉

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清远职业技术学院,广东 清远 511510

广东科贸职业学院,广州 511500

佛山科学技术学院,广东 佛山 528225

禾花鲤 转录组 肌肉相关基因 分子标记

2024

10.16815/j.cnki.11-5436/s.2024.28.015

农业工程技术

农业工程技术

ISSN：
年,卷(期)：2024.44(28)