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玉米同义密码子偏爱性分析

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应用CodonW软件对玉米(Zea mays)基因组中的7 402个蛋白质编码基因序列进行了分析,计算了位于密码子3个位置的G+C含量、有效密码子数、同义密码子的使用频率等,并确定了玉米的最优密码子.结果显示,玉米密码子第3位的G+C含量明显高于第1、2位,表现出对以G或C碱基结尾的密码子发生强烈偏向使用;且确定的27种最优密码子均以G或C碱基结尾.分析结果对指导外源基因进行分子改造,提高其在玉米中的表达效率及完善玉米基因预测软件和程序,提高新基因预测和基因组注释准确性等具有重要意义.
Analysis of Synonymous Codon Bias in Maize

刘汉梅、何瑞、张怀渝、黄玉碧

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四川农业大学生命理学院,雅安,625014

四川农业大学玉米所,雅安,625014

四川农业大学农学院,雅安,625014

玉米 密码子偏爱性 最优密码子

四川省教育厅重点项目

2006A018

2010

10.3969/j.issn.1674-7968.2010.03.007

农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.801
ISSN：1674-7968
年,卷(期)：2010.18(3)
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