农业生物技术学报2021,Vol.29Issue(2) :288-297.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2021.02.009

基于RNA-seq技术挖掘杂交绵羊群体肌肉性状相关基因

Identify the Genes Related to Muscle Traits in Crossbred Sheep Populations (Ovis aries) by RNA-seq Technology

史金平 马贵山 张全伟 刘婷 童建伟 孙鉴弘 魏玉兵 杨磊 成述儒
农业生物技术学报2021,Vol.29Issue(2) :288-297.DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2021.02.009

基于RNA-seq技术挖掘杂交绵羊群体肌肉性状相关基因

Identify the Genes Related to Muscle Traits in Crossbred Sheep Populations (Ovis aries) by RNA-seq Technology

史金平 1马贵山 2张全伟 3刘婷 1童建伟 4孙鉴弘 4魏玉兵 4杨磊 1成述儒1
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作者信息

  • 1. 甘肃农业大学动物科学技术学院,兰州730070
  • 2. 甘肃省天祝藏族自治县农业农村局,武威733299
  • 3. 甘肃农业大学生命科学技术学院,兰州730070
  • 4. 甘肃省张掖市甘州区平山湖蒙古族乡畜牧兽医站,张掖734000
  • 折叠

摘要

肉质性能是影响绵羊(Ovis aries)养殖效益的主要经济性状,本研究旨在通过RNA-seq技术挖掘绵羊肉质品质相关基因,筛选优良商品代绵羊群体.以小尾寒羊(Small-tailed Han sheep,STH)母羊×萨福克(Suffolk sheep,SFK)公羊杂交一代(F1)商品代群体和小尾寒羊母羊(STH)×蒙古羊(Mongolian sheep,MG)公羊杂交一代(F1)商品代群体为研究对象,测定其屠宰性能和肉质品质,通过背最长肌转录组分析,挖掘影响绵羊肉质性状关键基因.结果显示,STH(♀)×SFK(♂)群体的屠宰性能和肉质品质均优于STH(♀)×MG(♂)群体.转录组结果显示,2个杂交群体背最长肌组织存在397个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),主要富集在生长、发育等46个基因本体(Gene Ontology,GO)项和磷脂酰肌醇3-激酶(phosphatidyl inositol-3-kinase,PI3K)、蛋白激酶B(protein kinase B,Akt)所组成的信号通路PI3K/Akt、氨基酸合成等26条通路.根据功能和通路分析,筛选脂联素基因(adiponectin,ADIPOQ)、胰岛素样生长因子结合蛋白7基因(insulin-like growth factor binding protein 7,IGFBP7)、心脏α肌动蛋白基因(actinα1,cardiac muscle,ACTC1)3个基因作为肉质性状相关的候选基因.qRT-PCR结果显示,STH(♀)×SFK(♂)群体背最长肌中ADIPOQ和IGFBP7相对表达量显著高于STH×MG群体(P<0.01),而ACTC1表达量显著低于STH(♀)×MG(♂)群体(P<0.01).本研究表明,STH×SFK群体在屠宰性能、肉质品质方面均优于STH×MG群体,经济效益明显.筛选获得的差异表达基因可作为改良绵羊肉质性状的候选基因.

关键词

绵羊/比较转录组/屠宰性能/肉质品质/商品代畜群

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基金项目

甘肃省甘肃农业大学学科建设基金(GAU-XKJS-2018-024)

农业行业专项-牧区极端条件下牛羊应急专用饲料的开发与示范(201303062-5)

出版年

2021
农业生物技术学报
中国农业大学 中国农业生物技术学会

农业生物技术学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.801
ISSN:1674-7968
被引量1
参考文献量11
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